python - SIGKILL 在一个简单的 python 脚本中添加列

Question

我有一个文件，它有一个单行标题和一个带有值的长列。我想添加第二列，其中包含从 10981(step = 1)开始直到文件末尾的值(当然省略标题)。问题是脚本需要大量内存，我的电脑崩溃了，可能是因为脚本制作不好(对不起，我是新编程!)。我完成的脚本是这样的:

with open ('chr1.phyloP46way.placental2.wigFix', 'w') as file_open:
    num = 10981
    text = file_open.readlines()
    next (text)
    for line in text:
        num = num + 1
        print line.strip() + '\t' + str(num)

由于我的电脑在运行时崩溃，我尝试在pycharm中测试它并出现以下错误，我所看到的可能是由于内存不足:

Process finished with exit code 137 (interrupted by signal 9: SIGKILL)

有解决办法吗？

非常感谢!

Answer 1

如果您的系统资源不足，可能的罪魁祸首是 readlines() 调用，它会导致 Python 尝试将整个文件加载到内存中。没有必要这样做......文件对象本身可以用作迭代器来逐行读取文件:

with open ('chr1.phyloP46way.placental2.wigFix', 'w') as file_open:
    num = 10981
    next (file_open)
    for line in file_open:
        num = num + 1
        print line.strip() + '\t' + str(num)