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python - Seaborn clustermap 不显示所有行注释

转载 作者:太空宇宙 更新时间:2023-11-03 14:43:03 30 4
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heatmap picture

我正在创建一个包含 529 个基因列表的聚类图。由于某种原因,并非数据帧索引中的所有基因都显示在聚类图中。我附上了一张显示问题的图片。任何帮助将不胜感激。

def create_heatmap(dataframe, title):
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as pyplot
sns_plot = sns.clustermap(dataframe,mask=False,row_cluster=True,linewidth=.05,
linecolor="grey",col_cluster=False,standard_scale=0
,cmap="Greys",square=True,figsize=(12,(.2*(len(dataframe.index)))))
sns_plot.savefig("{}.png".format(title))
return sns_plot

最佳答案

您可能希望使用 yticklabels 关键字参数来标记热图中的所有行:

sns.clustermap(...,  yticklabels=True)

关于python - Seaborn clustermap 不显示所有行注释,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/51829462/

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