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我有一个包含 double 值(64 位 float 据)的二进制文件。使用 numpy fromfile
>>> data1 = numpy.fromfile(open('myfile', 'rb'))
我收到了正确的数据(我使用 data1 = numpy.fromfile('myfile') 获得了相同的数据)
>>> data1
array([ 1.29000000e-07, 3.70000000e-08, 3.80000000e-08,
3.70000000e-08, 3.60000000e-08, 3.80000000e-08,
3.80000000e-08, 3.70000000e-08, 3.80000000e-08,
3.60000000e-08, 3.80000000e-08, 3.70000000e-08,
3.60000000e-08, 3.60000000e-08, 3.80000000e-08,
3.50000000e-08, 3.80000000e-08, 3.80000000e-08,
3.80000000e-08, 3.60000000e-08, 3.70000000e-08,
3.60000000e-08, 3.70000000e-08, 3.70000000e-08,
3.60000000e-08, 3.50000000e-08, 3.70000000e-08,
3.70000000e-08, 3.60000000e-08, 3.50000000e-08,
3.80000000e-08, 3.80000000e-08, 3.60000000e-08,
3.50000000e-08, 3.90000000e-08, 3.70000000e-08,
3.70000000e-08, 3.70000000e-08, 3.50000000e-08,
3.70000000e-08, 3.60000000e-08, 3.70000000e-08,
3.80000000e-08, 3.90000000e-08, 3.90000000e-08,
3.60000000e-08, 3.60000000e-08, 3.70000000e-08,
3.60000000e-08, 3.80000000e-08, 3.70000000e-08,
3.50000000e-08, 3.50000000e-08, 3.60000000e-08,
3.60000000e-08, 3.70000000e-08, 3.50000000e-08,
3.70000000e-08, 3.60000000e-08, 3.80000000e-08,
3.80000000e-08, 3.80000000e-08, 3.80000000e-08,
3.90000000e-08, 3.90000000e-08, 3.50000000e-08,
3.80000000e-08, 3.80000000e-08, 3.70000000e-08,
3.70000000e-08, 3.60000000e-08, 3.80000000e-08,
3.60000000e-08, 3.70000000e-08, 3.70000000e-08,
3.80000000e-08, 3.60000000e-08, 3.60000000e-08,
3.50000000e-08, 3.80000000e-08, 3.60000000e-08,
3.70000000e-08, 3.60000000e-08, 3.80000000e-08,
3.50000000e-08, 3.80000000e-08, 3.70000000e-08,
3.60000000e-08, 3.70000000e-08, 3.90000000e-08,
3.60000000e-08, 3.60000000e-08, 3.90000000e-08,
3.80000000e-08, 3.60000000e-08, 3.60000000e-08,
3.70000000e-08, 3.70000000e-08])
我现在使用 xz 压缩此文件
xz -k myfile
然后尝试使用lzma模块读取Python中的数据
>>> data2 = numpy.fromfile(lzma.open('myfile.xz'))
>>> data2
array([ 2.05244522e-289, 3.09873319e-303, -9.10852154e-136,
9.99900586e-150, -7.22647881e+061, -3.03508634e-168,
1.40409926e+097, -8.66961452e+219, 2.28992199e-308,
-7.28706929e+173, 1.41101250e+029, -2.94590886e-279,
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-1.22865109e+263, 2.62485731e+044, 4.52556260e-312,
1.18164036e-240, 3.56496646e-311, -2.82751232e+286,
1.69336097e+127])
为什么会发生这种情况？通过read查看文件对象的内容给出
>>> open('myfile', 'rb').read()
b'B$\xf7\xffgP\x81>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xb3z\xea\x05]\xcab>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>'
>>> lzma.open('myfile.xz').read()
b'B$\xf7\xffgP\x81>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xb3z\xea\x05]\xcab>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\xb3z\xea\x05]\xcab>\xd1\x1e\xae#\xaefd>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x85U\xef\x82\x1e\xf0d>\xd1\x1e\xae#\xaefd>g\xb1+e\xcdSc>g\xb1+e\xcdSc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>\x1c\xe8l\xc4=\xddc>'
这对我来说看起来不错。类型似乎也正确:
>>> type(data1)
<class 'numpy.ndarray'>
>>> type(data1[0])
<class 'numpy.float64'>
>>> type(data2)
<class 'numpy.ndarray'>
>>> type(data2[0])
<class 'numpy.float64'>
我希望数组 data1 和 data2 的内容相等。
最佳答案
所以，我不知道该解决方案的原因，但我有一个。我从 tofile 生成了一个文件方法。
我使用frombuffer读取了压缩版本。
data_xz = np.frombuffer(lzma.open('data.bin.xz', mode='rb').read())
data_bin = np.fromfile('data.bin')
读取时数据相等。
我的猜测是，在某个地方，np.fromfile 读取字节的处理揭示了普通读取方法和 lzma 模块中的方法的差异。
无论如何，存储数据最好使用一致的格式。对于小数据集，纯文本就可以了。另外，还有 joblib 的 persistence module或HDF5 for Python .
关于python - 使用 numpy fromfile 结合 lzma open 读取二进制文件，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/46601727/
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