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用于微阵列数据稳健多阵列平均的python脚本

转载 作者:太空宇宙 更新时间:2023-11-03 14:35:05 26 4
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我试过谷歌,但没有成功。我已经看到一些对使用 python 完成的稳健多数组平均的弱引用,但没有代码。我对重新发明轮子不太感兴趣。关于 python 模块、脚本的任何建议....

如果我能找到一个很好的算法解释或示例,我会编写一个 python 实现来分享。

如果你不确定我在说什么,你可以看看这个,虽然这不是定义。 http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/bioinfo/ref/gcrma.html

最佳答案

尽管这个问题是在六年多以前提出的,但当我最近问自己同样的问题时,我仍然找不到 RMA 的良好 Python 实现。因此,我对该方法进行了大量研究并自己编写了一个:

我还写了一篇关于它的文章,其中涉及一些技术细节:

pyAffy: An efficient Python/Cython implementation of the RMA method for processing raw data from Affymetrix expression microarrays

关于用于微阵列数据稳健多阵列平均的python脚本,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/2293143/

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