python - 强制 conda 环境中的 rpy2 使用 conda 环境之外的 R

Question

我开始使用 conda 环境。我知道我可以打开并使用 R jupiter 笔记本，但我首选的工作流程是在 python 笔记本中使用 R，必要时使用 rpy2 并在两种语言之间推/拉数据

%R push data
%R run something
%R pull output

但是现在当我在 conda 环境中运行 rpy2 时，它会搜索 conda 环境中 R 文件夹中的所有包。我想使用我的主目录中安装的软件包或我工作的计算机中安装的软件包，而无需为每个 conda 环境重新安装所有内容。这可能吗？

Answer 1

有多种方法可以告诉 R 有关包目录的信息 ( http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/libPaths.html )。

尝试设置环境变量 R_LIBS 或 R_LIBS_USER(在笔记本中的 %load_ext rpy2.ipython 之前)。