python ，matplotlib : specgram data array values does not match specgram plot

Question

我正在使用 matplotlib.pyplot.specgram 和 matplotlib.pyplot.pcolormesh 绘制地震信号的频谱图。

背景信息 - 使用 pcolormesh 的原因是我需要对频谱图数据数组进行算术运算，然后重新绘制生成的频谱图(对于三分量地震图 - 东、北和垂直 - 我需要工作出水平光谱幅度并将垂直光谱除以水平光谱)。使用频谱图阵列数据比使用单个振幅频谱更容易做到这一点

我发现在进行算术运算后的频谱图具有意想不到的值。经过进一步调查，事实证明使用 pyplot.specgram 方法制作的频谱图与使用 pyplot.pcolormesh 制作的频谱图和从 pyplot.specgram 方法返回的数据数组相比具有不同的值。两个图/数组应包含相同的值，我无法弄清楚为什么它们不包含。

例子:的情节

plt.subplot(513)
PxN, freqsN, binsN, imN = plt.specgram(trN.data, NFFT = 20000, noverlap = 0, Fs = trN.stats.sampling_rate, detrend = 'mean', mode = 'magnitude')
plt.title('North')
plt.xlabel('Time [s]')
plt.ylabel('Frequency [Hz]')
plt.clim(0, 150)
plt.colorbar()
#np.savetxt('PxN.txt', PxN)

看起来和剧情不一样

plt.subplot(514)
plt.pcolormesh(binsZ, freqsZ, PxN)
plt.clim(0,150)
plt.colorbar()

即使“PxN”数据数组(即每个段的频谱图数据值)由第一种方法生成并在第二种方法中重新使用。

有人知道为什么会这样吗？

附言我意识到我对 NFFT 的值(value)不是一个平方数，但在我编码的这个阶段并不重要。

附言我不知道“imN”数组(pyplot.specgram 的第四个返回变量)是什么以及它的用途....

Answer 1

首先，让我们展示一个您所描述内容的示例，以便其他人

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
np.random.seed(1)

# Brownian noise sequence
x = np.random.normal(0, 1, 10000).cumsum()

fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(nrows=2, figsize=(8, 10))

values, ybins, xbins, im = ax1.specgram(x, cmap='gist_earth')
ax1.set(title='Specgram')
fig.colorbar(im, ax=ax1)

mesh = ax2.pcolormesh(xbins, ybins, values, cmap='gist_earth')
ax2.axis('tight')
ax2.set(title='Raw Plot of Returned Values')
fig.colorbar(mesh, ax=ax2)

plt.show()

幅度差异

您会立即注意到标绘值的大小差异。

默认情况下，plt.specgram 不会绘制它返回的“原始”值。相反，它将它们缩放到分贝(换句话说，它绘制振幅的 10 * log10)。如果您不希望它缩放，则需要指定 scale="linear"。然而，为了查看频率组成，对数刻度将最有意义。

考虑到这一点，让我们模仿 specgram 的作用:

plotted = 10 * np.log10(values)

fig, ax = plt.subplots()
mesh = ax.pcolormesh(xbins, ybins, plotted, cmap='gist_earth')

ax.axis('tight')
ax.set(title='Plot of $10 * log_{10}(values)$')
fig.colorbar(mesh)

plt.show()

改用对数色标

或者，我们可以在图像上使用对数范数并得到类似的结果，但更清楚地表明颜色值在对数尺度上:

from matplotlib.colors import LogNorm

fig, ax = plt.subplots()
mesh = ax.pcolormesh(xbins, ybins, values, cmap='gist_earth', norm=LogNorm())

ax.axis('tight')
ax.set(title='Log Normalized Plot of Values')
fig.colorbar(mesh)

plt.show()

imshow 与 pcolormesh

最后，请注意，我们展示的示例没有应用插值，而原始 specgram 图应用了插值。 specgram 使用 imshow，而我们一直在使用 pcolormesh 绘图。在这种情况下(常规网格间距)我们可以使用其中任何一种。

在这种情况下，imshow 和 pcolormesh 都是非常好的选择。但是，如果您使用的是大型数组，imshow 的性能会好得多。因此，您可能会考虑使用它，即使您不想插值(例如 interpolation='nearest' 关闭插值)。

举个例子:

extent = [xbins.min(), xbins.max(), ybins.min(), ybins.max()]

fig, ax = plt.subplots()
mesh = ax.imshow(values, extent=extent, origin='lower', aspect='auto',
                 cmap='gist_earth', norm=LogNorm())

ax.axis('tight')
ax.set(title='Log Normalized Plot of Values')
fig.colorbar(mesh)

plt.show()