python - 从 Pandas 数据框创建 igraph 图

Question

我有以下 pandas 数据框包含如下边缘列表:

        name1              name2    weight
0  $hort, Too  Alexander, Khandi  0.083333
1  $hort, Too             B-Real  0.083333

我想从 pandas 数据框(而不是文件)创建一个 igraph 对象。该图太大，所以我无法将其转换为邻接矩阵。如何做到这一点？

Answer 1

我也在寻找 Networkx from_pandas_dataframe 在 igraph 中的等效函数，我发现使用 Graph.TupleList() 作为最佳解决方案。所以基本上你从 3 个 pandas 列创建一个元组，然后使用这个函数来创建网络。

tuples = [tuple(x) for x in df.values]
Gm = igraph.Graph.TupleList(tuples, directed = True, edge_attrs = ['weight'])