python - Rpy2 & ggplot2 : LookupError 'print.ggplot'

Question

不受任何已有的 R、Rpy2 和 ggplot2 知识的阻碍，我永远不会不喜欢从 Python 创建一个普通表格的散点图。

为了设置它，我刚刚安装了:

• Ubuntu 11.10 64 位
• R 版本 2.14.2(来自 r-cran 镜像)
• ggplot2(通过 R> install.packages('ggplot2'))
• rpy2-2.2.5(通过easy_install)

在此之后，我能够使用 ggplot2 从交互式 R session 中绘制一些示例数据帧。

但是，当我只是尝试导入 ggplot2 时(如我在网上找到的示例中所见)，我收到以下错误:

from rpy2.robjects.lib import ggplot2
  File ".../rpy2/robjects/lib/ggplot2.py", line 23, in <module>
    class GGPlot(robjects.RObject):
  File ".../rpy2/robjects/lib/ggplot2.py", line 26, in GGPlot
    _rprint = ggplot2_env['print.ggplot']
  File ".../rpy2/robjects/environments.py", line 14, in __getitem__
    res = super(Environment, self).__getitem__(item)
LookupError: 'print.ggplot' not found

谁能告诉我我做错了什么？正如我所说，有问题的导入来自在线示例，所以很可能我应该通过 rpy2 使用 gplot2 的其他方式。

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作为引用，与上述问题无关，这是我想要绘制的数据框示例，一旦我开始导入工作(查看示例应该不是问题)。这个想法是创建一个散点图，其长度在 x 轴上，百分比在 Y 轴上， bool 值用于为点着色，然后我想将其保存到文件(图像或 pdf)。鉴于这些要求非常有限，也欢迎使用替代解决方案。

     original.length row.retained percentage.retained
1               1875        FALSE                11.00
2               1143        FALSE                23.00
3                960        FALSE                44.00
4               1302        FALSE                66.00
5               2016        TRUE                 87.00

Answer 1

R 包 ggplot2 中的更改破坏了 rpy2 层。尝试使用 bitbucket 上 rpy2 代码的“默认”分支 (rpy2-2.3.0-dev) 的最近(我刚刚修复了这个)快照。

编辑:rpy2-2.3.0 比计划晚了几个月。我刚刚发布了一个错误修复版本 rpy2-2.2.6，应该可以解决这个问题。