python - 使用 rpy2 映射 python 元组和 R 列表？

Question

我在理解 rpy2 对象和 python 对象的映射时遇到了一些问题。

我有一个在 python 中返回一个元组对象的函数 (x)，我想用 R 对象列表或向量映射这个元组对象。

首先，我正在尝试这样做:

# return a python tuple into this r object tlist
robjects.r.tlist = get_max_ticks(x) 

#Convert list into dataframe
r('x <- as.data.frame(tlist,row.names=c("seed","ticks"))')

失败错误: rinterface.RRuntimeError: eval(expr, envir, enclos) 错误:找不到对象 'tlist'

所以我正在尝试另一种策略:

robjects.r["tlist"]  = get_max_ticks(x)
r('x <- as.data.frame(tlist,row.names=c("seed","ticks"))')

失败并出现此错误:TypeError: 'R' 对象不支持项目分配

你能帮我理解一下吗？非常感谢!!

Answer 1

使用globalEnv:

import rpy2.robjects as ro
r=ro.r

def get_max_ticks():
    return (1,2)
ro.globalEnv['tlist'] = ro.FloatVector(get_max_ticks())
r('x <- as.data.frame(tlist,row.names=c("seed","ticks"))')
print(r['x'])
#       tlist
# seed      1
# ticks     2

可以使用这种类型的符号访问 R 命名空间中的符号:robjects.r.tlist，但您不能以这种方式赋值。分配符号的方法是使用robject.globalEnv。

此外，R中的某些符号可能包含句点，例如data.frame。您不能使用类似于 robjects.r.data.frame 的符号在 Python 中访问此类符号，因为 Python 对周期的解释与 R 不同。所以我建议完全避免这种表示法，而是使用robjects.r['data.frame']，因为无论符号名称是什么，此表示法都有效。