- iOS/Objective-C 元类和类别
- objective-c - -1001 错误,当 NSURLSession 通过 httpproxy 和/etc/hosts
- java - 使用网络类获取 url 地址
- ios - 推送通知中不播放声音
我知道网上有一些关于 SimRank 的资源,但我找不到任何代码来为 Jung Graph 实现 SimRank。基本上,在无向图中,2 个节点之间的 SimRank 相似度定义如下
然后我有一个jung Graph
import edu.uci.ics.jung.graph.Graph;
import edu.uci.ics.jung.graph.UndirectedSparseGraph;
public SimpleGraphView() {
// Graph<V, E> where V is the type of the vertices and E is the type of the edges
g = new UndirectedSparseGraph<Integer, String>();
// Add some vertices. From above we defined these to be type Integer.
g.addVertex((Integer)1);
g.addVertex((Integer)2);
g.addVertex((Integer)3);
g.addEdge("Edge-A", 1, 2);
g.addEdge("Edge-B", 2, 3);
}
我将如何实现该算法?我知道这是一个递归,但如果方便的话,我可以限制迭代
最佳答案
尝试根据 http://en.wikipedia.org/wiki/SimRank 实现
这未经过广泛测试或验证,但无论如何至少可以作为一个起点。
package stackoverflow;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Collection;
import java.util.LinkedHashMap;
import java.util.List;
import java.util.Locale;
import java.util.Map;
import edu.uci.ics.jung.graph.Graph;
import edu.uci.ics.jung.graph.UndirectedSparseGraph;
import edu.uci.ics.jung.graph.util.Pair;
public class JUNGSimRank
{
public static void main(String[] args)
{
Graph<Integer, String> g =
new UndirectedSparseGraph<Integer, String>();
g.addVertex((Integer)1);
g.addVertex((Integer)2);
g.addVertex((Integer)3);
g.addEdge("Edge-A", 1, 2);
g.addEdge("Edge-B", 2, 3);
Map<Pair<Integer>, Float> simRank = computeSimRank(g);
print(g, simRank);
}
/**
* Compute the SimRank for the vertices of the given graph.
*
* @param <V> The vertex type
* @param g The graph
* @return The SimRank, as a map from pairs of vertices to
* their similarity
*/
private static <V> Map<Pair<V>, Float> computeSimRank(Graph<V,?> g)
{
final int kMax = 5;
final float C = 0.8f;
Map<Pair<V>, Float> currentR = computeInitialSimRank(g);
Map<Pair<V>, Float> nextR = new LinkedHashMap<Pair<V>, Float>();
for (int k=0; k<kMax; k++)
{
for (V a : g.getVertices())
{
for (V b : g.getVertices())
{
float sum = computeSum(g, a, b, currentR);
Pair<V> ab = new Pair<V>(a,b);
int sia = g.inDegree(a);
int sib = g.inDegree(b);
if (sia == 0 || sib == 0)
{
nextR.put(ab, 0.0f);
}
else
{
nextR.put(ab, C / (sia * sib) * sum);
}
}
}
//System.out.println("After iteration "+k);
//print(g, nextR);
Map<Pair<V>, Float> temp = nextR;
nextR = currentR;
currentR = temp;
}
return currentR;
}
/**
* Compute the sum of all SimRank values of all incoming
* neighbors of the given vertices
*
* @param <V> The vertex type
* @param g The graph
* @param a The first vertex
* @param b The second vertex
* @param simRank The current SimRank
* @return The sum of the SimRank values of the
* incoming neighbors of the given vertices
*/
private static <V> float computeSum(
Graph<V,?> g, V a, V b, Map<Pair<V>, Float> simRank)
{
Collection<V> ia = g.getPredecessors(a);
Collection<V> ib = g.getPredecessors(b);
float sum = 0;
for (V iia : ia)
{
for (V ijb : ib)
{
Pair<V> key = new Pair<V>(iia, ijb);
Float r = simRank.get(key);
sum += r;
}
}
return sum;
}
/**
* Compute the initial SimRank for the vertices of the given graph.
* This initial SimRank for two vertices (a,b) is 0.0f when
* a != b, and 1.0f when a == b
*
* @param <V> The vertex type
* @param g The graph
* @return The SimRank, as a map from pairs of vertices to
* their similarity
*/
private static <V> Map<Pair<V>, Float> computeInitialSimRank(Graph<V,?> g)
{
Map<Pair<V>, Float> R0 = new LinkedHashMap<Pair<V>, Float>();
for (V a : g.getVertices())
{
for (V b : g.getVertices())
{
Pair<V> ab = new Pair<V>(a,b);
if (a.equals(b))
{
R0.put(ab, 1.0f);
}
else
{
R0.put(ab, 0.0f);
}
}
}
return R0;
}
/**
* Print a table with the SimRank values
*
* @param <V> The vertex type
* @param g The graph
* @param simRank The SimRank
*/
private static <V> void print(Graph<V,?> g, Map<Pair<V>, Float> simRank)
{
final int columnWidth = 8;
final String format = "%4.3f";
List<V> vertices = new ArrayList<V>(g.getVertices());
System.out.printf("%"+columnWidth+"s", "");
for (int j=0; j<vertices.size(); j++)
{
String s = String.valueOf(vertices.get(j));
System.out.printf("%"+columnWidth+"s", s);
}
System.out.println();
for (int i=0; i<vertices.size(); i++)
{
String s = String.valueOf(vertices.get(i));
System.out.printf("%"+columnWidth+"s", s);
for (int j=0; j<vertices.size(); j++)
{
V a = vertices.get(i);
V b = vertices.get(j);
Pair<V> ab = new Pair<V>(a,b);
Float value = simRank.get(ab);
String vs = String.format(Locale.ENGLISH, format, value);
System.out.printf("%"+columnWidth+"s", vs);
}
System.out.println();
}
}
}
关于java - 计算荣格图中的 SimRank?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/21640337/
我想做的是让 JTextPane 在 JPanel 中占用尽可能多的空间。对于我使用的 UpdateInfoPanel: public class UpdateInfoPanel extends JP
我在 JPanel 中有一个 JTextArea,我想将其与 JScrollPane 一起使用。我正在使用 GridBagLayout。当我运行它时,框架似乎为 JScrollPane 腾出了空间,但
我想在 xcode 中实现以下功能。 我有一个 View Controller 。在这个 UIViewController 中,我有一个 UITabBar。它们下面是一个 UIView。将 UITab
有谁知道Firebird 2.5有没有类似于SQL中“STUFF”函数的功能? 我有一个包含父用户记录的表,另一个表包含与父相关的子用户记录。我希望能够提取用户拥有的“ROLES”的逗号分隔字符串,而
我想使用 JSON 作为 mirth channel 的输入和输出,例如详细信息保存在数据库中或创建 HL7 消息。 简而言之,输入为 JSON 解析它并输出为任何格式。 最佳答案 var objec
通常我会使用 R 并执行 merge.by,但这个文件似乎太大了,部门中的任何一台计算机都无法处理它! (任何从事遗传学工作的人的附加信息)本质上,插补似乎删除了 snp ID 的 rs 数字,我只剩
我有一个以前可能被问过的问题,但我很难找到正确的描述。我希望有人能帮助我。 在下面的代码中,我设置了varprice,我想添加javascript变量accu_id以通过rails在我的数据库中查找记
我有一个简单的 SVG 文件,在 Firefox 中可以正常查看 - 它的一些包装文本使用 foreignObject 包含一些 HTML - 文本包装在 div 中:
所以我正在为学校编写一个 Ruby 程序,如果某个值是 1 或 3,则将 bool 值更改为 true,如果是 0 或 2,则更改为 false。由于我有 Java 背景,所以我认为这段代码应该有效:
我做了什么: 我在这些账户之间创建了 VPC 对等连接 互联网网关也连接到每个 VPC 还配置了路由表(以允许来自双方的流量) 情况1: 当这两个 VPC 在同一个账户中时,我成功测试了从另一个 La
我有一个名为 contacts 的表: user_id contact_id 10294 10295 10294 10293 10293 10294 102
我正在使用 Magento 中的新模板。为避免重复代码,我想为每个产品预览使用相同的子模板。 特别是我做了这样一个展示: $products = Mage::getModel('catalog/pro
“for”是否总是检查协议(protocol)中定义的每个函数中第一个参数的类型? 编辑(改写): 当协议(protocol)方法只有一个参数时,根据该单个参数的类型(直接或任意)找到实现。当协议(p
我想从我的 PHP 代码中调用 JavaScript 函数。我通过使用以下方法实现了这一点: echo ' drawChart($id); '; 这工作正常,但我想从我的 PHP 代码中获取数据,我使
这个问题已经有答案了: Event binding on dynamically created elements? (23 个回答) 已关闭 5 年前。 我有一个动态表单,我想在其中附加一些其他 h
我正在尝试找到一种解决方案,以在 componentDidMount 中的映射项上使用 setState。 我正在使用 GraphQL连同 Gatsby返回许多 data 项目,但要求在特定的 pat
我在 ScrollView 中有一个 View 。只要用户按住该 View ,我想每 80 毫秒调用一次方法。这是我已经实现的: final Runnable vibrate = new Runnab
我用 jni 开发了一个 android 应用程序。我在 GetStringUTFChars 的 dvmDecodeIndirectRef 中得到了一个 dvmabort。我只中止了一次。 为什么会这
当我到达我的 Activity 时,我调用 FragmentPagerAdapter 来处理我的不同选项卡。在我的一个选项卡中,我想显示一个 RecyclerView,但他从未出现过,有了断点,我看到
当我按下 Activity 中的按钮时,会弹出一个 DialogFragment。在对话框 fragment 中,有一个看起来像普通 ListView 的 RecyclerView。 我想要的行为是当
我是一名优秀的程序员,十分优秀!