r - R中的Bron-Kerbosch算法

Question

我想在 igraph 中手动实现 Bron-Kerbosch 算法。我想用 Wikipedia page 中的图表复制示例.这是我到目前为止提出的解决方案。

library(igraph)
g <- graph.formula(1-2,1-5,5-2,2-3,3-4,4-5,4-6)
P <- as.vector(V(g))
bron_kerbosch <- function(R,P,X) {

    if (length(P) == 0 && length(X) == 0) {
        print (R)
    } else {
        for (v in P) {
            neis <- as.vector(neighbors(g,v))
            bron_kerbosch(union(R,v),intersect(P,neis),intersect(X,neis))
            P <- c(P[-which(P==v)])
            X <- c(X,v)
        }
    }
}
> bron_kerbosch(c(),P,c())
[1] 1 2 3
[1] 2 4
[1] 3 5
[1] 4 5
[1] 5 6

答案应该是: [[1, 2, 5], [2, 3], [3, 4], [4, 5], [4, 6]]我从 1 开始索引，而不是从 0 开始。知道我做错了什么吗？

Answer 1

我刚刚找到了解决方案。我使用了 g 图的索引，而不是名称:/。所以我改了两行:

 P <- V(g)$name
 neis <- neighbors(g,v)$name

这将适用于字符而不是数字。结果:

 [1] "1" "2" "5"
 [1] "2" "3"
 [1] "5" "4"
 [1] "3" "4"
 [1] "4" "6"

所以顶点没有排序 (5,4) 应该是 (4,5) 但我认为这并不重要。但是，最好将其写入整数而不是字符。