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algorithm - 关于 Smith-Waterman 算法的问题

转载 作者:塔克拉玛干 更新时间:2023-11-03 04:20:24 34 4
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我正在使用 Smith-Waterman 算法运行一些字符串匹配测试。我目前正在使用 SimMetrics(Java 开源项目)来运行测试。

谁能解释为什么我比较“Bloggs J”。到“Bloggs”我得到 1.0 的相似度值?

明显有差距(例如'o'和'.'),但似乎没有受到惩罚。

提前谢谢你。

最佳答案

Smith-Waterman Algorithm是一种局部对齐算法。这意味着它旨在对齐对齐良好的片段字符串,而不是对齐整个字符串。您所说的“差距”不应被视为差距,因为它被认为发生在对齐区域之外。长度为“Bloggs”的字符串可能无法更好地与“Bloggs J”对齐。比“博客”做的。如果你想要全局对齐,你应该使用 Needleman-Wunsch Algorithm相反。

关于algorithm - 关于 Smith-Waterman 算法的问题,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/3175341/

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