python - 使用参数中的变量运行 Python 脚本

Question

我有一个运行如下的 python 命令:

python script.py -file 1000G_EUR_Phase3_plink/1000G.NUMBER --out GTEx_Cortex.chrNUMBER

我想用数字 1:20 替换 NUMBER 变量。因此，如果我将 NUMBER 替换为 1，它将如下所示:

python script.py -file 1000G_EUR_Phase3_plink/1000G.1 --out GTEx_Cortex.chr1

这是第二次迭代(如果我用 2 替换它):

python script.py -file 1000G_EUR_Phase3_plink/1000G.2 --out GTEx_Cortex.chr2

但我不想一直手动更改 NUMBER 20 次。我想自动化整个事情。

如何在命令提示符下执行此操作？这应该在 VIM 中完成还是在 python 中有其他方法？

谢谢!

Answer 1

for i in `seq 1 20`;do python script.py -file 1000G_EUR_Phase3_plink/1000G.${i} --annot GTEx_Cortex_chr1.annot.gz --out GTEx_Cortex.chr${i};done