linux - 在linux上根据对应的数字展开每一行文本文件

Question

我能否仅通过基本的 shell 处理或 awk 或 linux 上的 sed 将第一种格式转换为第二种格式？

这是一个玩具示例:

这种文本文件是我有的，三个cols，col2和col3 like range，左闭右开，

chr1 0 2 0  
chr1 2 6 1.5  
chr2 0 3 0  
chr2 3 10 2.1

转移描述每个位置为:

chr1 0 0  
chr1 1 0  
chr1 2 1.5  
chr1 3 1.5  
chr1 4 1.5  
chr1 5 1.5  
chr2 0 0      
chr2 1 0  
chr2 2 0    
chr2 3 2.1  
...  
chr2 9 2.1

Answer 1

这可以通过awk来完成，

awk '{for(i=$2;i<$3;i++)print $1,i,$4}' file

将范围的开始和结束分别设置为 $2 和 $3。并按要求打印每一行的范围。