arrays - 大型 Bash 数组或注销终止

Question

我正在使用调用 Perl 脚本来执行作业的 bash 脚本。然后将该作业的结果附加到 bash 中的数组并求和。打印每次调用 Perl 脚本后的总和。脚本运行一段时间后，它会停止打印总和，而不会出现错误消息。

例子:

for i in {1..1999}; 
do
  fi="$(printf "%06d" $i)_sys6_uw_lipid_data.pdb"
  r_sq_value=$(perl r_value.pl "$fi")
  all_r_sq_values+=($r_sq_value)

sum=$(
awk 'BEGIN {t=0; for (i in ARGV) t+=ARGV[i]; print t}' "${all_r_sq_values[@]}"
)

echo "$sum <--- SUM"

done

该脚本在一段时间内工作正常，但很长一段时间后脚本停止打印总和。

例子:

... skipping ... 
5.20884e+06 <--- SUM
5.22297e+06 <--- SUM
5.23754e+06 <--- SUM
5.25246e+06 <--- SUM
5.26714e+06 <--- SUM
5.28179e+06 <--- SUM
5.29737e+06 <--- SUM
 <--- SUM
 <--- SUM
 <--- SUM
 <--- SUM
 <--- SUM

如果没有错误，我不确定这是因为脚本还是因为计算机因进入休眠而终止作业。它读取的所有数据文件都是完整的，并且可以单独使用 Perl 脚本。

如有任何建议或意见，我们将不胜感激。

谢谢

Answer 1

将其更改为:

for i in {1..1999}; 
 do
  fi="$(printf "%06d" $i)_sys6_uw_lipid_data.pdb"
  r_sq_value=$(perl r_value.pl "$fi")
  (( all_r_sq_values += ($r_sq_value) ))

sum=$(
 awk 'BEGIN {t=0; for (i in ARGV) t+=ARGV[i]; print t}'     "${all_r_sq_values[@]}"
)

echo "$sum <--- SUM"

done