linux - 编译 FSL : 'fatal error: libxml++/libxml++.h: No such file or directory'

Question

我知道这个问题经常出现，但我查看了所有其他答案，但没有一个与我相关。

我正在尝试从源代码编译神经成像软件 FSL(我必须这样做，我的 Linux 发行版不支持它)。我已按照所有说明进行操作 listed here , 大约 80% 已编译。然而，有几个模块没有成功，它们似乎都可以追溯到尝试编译 CiftiLib-master 时出现的问题。

根据说明，每当我尝试运行“make”命令时，它都会返回:

Makefile:34: warning: overriding recipe for target 'clean'
/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/config/common/rules.mk:32: warning: ignoring old recipe for target 'clean'
gcc -c -Wall -ansi -pedantic -Wno-long-long     -m64  -g -O3 -fexpensive-optimizations -m64  -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/boost -g -DCIFTILIB_USE_XMLPP -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/libxml2 -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/libxml++-2.6 -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/lib/libxml++-2.6/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/boost -I./Common -I./Nifti -I./Cifti  -I. -I/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/include  -o Common/XmlAdapter.o Common/XmlAdapter.cxx
In file included from Common/XmlAdapter.cxx:28:0:
Common/XmlAdapter.h:56:10: fatal error: libxml++/libxml++.h: No such file or directory
 #include "libxml++/libxml++.h"
          ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
compilation terminated.
make: *** [Makefile:19: Common/XmlAdapter.o] Error 1

因为我不是要编译一个 foo.c 文件，而是要编写一个程序，所以我看到的很多建议似乎并不适用于我。我已经安装了其他帖子中建议的所有各种 libxml 包(libxml2、libxslt1 等)。

我无法理解错误消息的正反面:我根本不熟悉编译 C 程序(这是我第一次认真地尝试从源代码构建)。如果答案很明显而我只是不认识它，请提前道歉。

我在使用 Antergos Linux(Arch 内核)，我认为这可能是问题的来源，因为所有其他提出此问题的人似乎都在使用 Debian 或 Ubuntu。

Answer 1

我一直在尝试解决同样的问题。看来libxml++默认是和FSL捆绑在一起的，捆绑的版本编译不通过。

解决方案 #1:安装并使用较旧的编译器(例如 GCC 4.8)，因为项目的配置是为了适应那些旧的编译器

我不能保证这个解决方案，因为我自己还没有尝试过(因为显然，我喜欢让自己的生活变得困难)，但这可能是你最好的选择。

解决方案 #2:手动修复问题

注意:这不是一个全面的解决方案，但它可能会为您指明正确的方向。

您的第一个问题很可能是您默认使用的编译器使用的 C++ 标准比编写用于编译的项目更新的 C++ 标准。这会导致输入流和输出流到 bool 值的隐式转换失败。您可能可以通过在 makefile 配置中弄乱编译器标志来解决它，但修复代码中有问题的部分可能更容易。相关行 (FSL 5.0.11) 是:

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/istreamparserinputbuffer.cc (line 42)
  return _input;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_input);

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/ostreamoutputbuffer.cc (line 32)
  return _output;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_output);

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/ostreamoutputbuffer.cc (line 39)
  return _output;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_output);

根据您尝试安装的版本，实际行号可能不同，但它们可能位于同一区域。

下一个问题是未为INC_XML++、INC_XML++CONF 和INC_XML2 定义包含路径> 在通用 makefile 配置中。这很可能是您系统的默认设置，因为没有 GCC 版本 > 4.8 的配置。通过添加以下行来编辑 config/generic/externallibs.mk 文件(具体添加到哪里并不重要):

# XML++
LIB_XML++ = ${FSLEXTLIB}
INC_XML++ = ${FSLEXTINC}/libxml++-2.6
INC_XML++CONF = ${FSLEXTLIB}/libxml++-2.6/include
INC_XML2 = ${FSLEXTINC}/libxml2

(我添加了 LIB_XML++，因为 lib 路径是由文件中的其他变量定义的，但我不是 100% 确定它是必要的。)

同样，这是在我的系统上修复它的原因。根据您下载的源代码版本，它可能会有所不同，但至少这是一个起点。

修复这些错误后，CiftiLib-master 目标应该可以编译。但是，如果您的系统与我的系统类似，那么这远不是构建过程中的唯一错误。查看 build.log 文件并搜索 error: 应该可以让您很好地了解哪些项目导致哪些错误，以及可能需要什么来修复这些错误。这些问题在本质上可能与 CiftiLib 的问题类似。

最后的提示:如果您的 libgd 项目无法编译，请查看 error: 消息。它可能会提示一些未声明的标识符(IMG_FMT_I420、PLANE_Y、PLANE_U、PLANE_V)。如果您在这些标识符前加上 VPX_，它应该可以工作。失败的原因是库更新删除了已弃用标识符的定义，迫使用户使用较新的前缀标识符。

我到此为止了。我假设一年后您仍然不会为此烦恼，但我将把它留给后代。