r - 无法调整 TCGABiolinks

Question

我已经使用 anaconda 安装了 TCGAbiolinks。当我尝试通过 library(TCGAbiolinks) 从 Rstudio 启动它时，弹出以下错误:

Error: package or namespace load failed for ‘TCGAbiolinks’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
namespace ‘blob’ 1.1.1 is being loaded, but >= 1.2.0 is required

我尝试更新 blob 或手动安装请求的版本，但随后出现错误:

package ‘blob=1.2.0’ is not available (for R version 3.6.1)

(我也曾尝试将 R 降级到旧版本 (3.6.0)，但问题仍然存在，并出现了附加警告，即 TCGAbiolinks 是为 3.6.1 制作的)

尝试安装 TGCAbiolinks 的开发者版本导致了不同的错误。

帮助将不胜感激!总体而言，我对命令行用法和 unix 还很陌生，没有想法。

Answer 1

您可以尝试使用 BiocManager 在 RStudio 上安装。

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) 安装.packages("BiocManager")

BiocManager::install("TCGAbiolinks")

图书馆(TCGAbiolinks)