linux - 如何将列中的值拆分为单独的列

Question

我的制表符分隔文件如下所示:

  ID   Pop  snp1  snp2  snp3  snp4  snp5
  AD62  1  0/1   1/1   .    1/1   0/.
  AD75  1  0/0   1/1   .    ./0   1/0
  AD89  1  .     1/0   1/1  0/0   1/.

我想分隔列(从第 3 列开始)，以便将由“/”字符分隔的值分隔到它自己的列中。但是，也有一些列缺少值(它们只包含“。”字符)，我希望将其视为“./”。这样两个“.”然后将字符分为自己的列。例如:

  ID   Pop  snp1     snp2     snp3     snp4     snp5
  AD62  1    0    1   1    1   .    .   1    1   0    .
  AD75  1    0    0   1    1   .    .   .    0   1    0
  AD89  1    .    .   1    0   1    1   0    0   1    .

谢谢

Answer 1

你可以使用 sed:

sed -e 's/ \. /\.\t\. /g' -e 's/\//\t/g' <your_file>