linux - 如何在linux shell命令中运行一个自定义的R函数？

Question

我想在带有 linux 的远程 HPC 上运行名为“run.plot.R”的 R 文件中的自定义函数。

我输入 linux 命令:

R CMD run.plot.R

但是 R 似乎还没有从文件中读取函数代码。如何将函数文件加载到 R 中然后运行它？

Answer 1

三个选项是:

Rscript run.plot.R

或

R CMD BATCH run.plot.R

或使用 littler 应用程序，请参阅 http://dirk.eddelbuettel.com/code/littler.html

所有这三个都以非交互模式运行。

如果你想交互运行，要么

R --file run.plot.R

或者通过

启动R

R

然后一旦 R 开始运行

source("run.plot.R")

但是，以上所有假设 run.plot.R 包含函数代码和运行这些 R 函数的 R 调用。

最后，给定文件名，是否生成或可以生成任何图将取决于远程 Linux 服务器上的运行方式，X 是否通过您正在使用的连接转发等。