linux - 在运行 Linux 的 Cray 系统上，如何在自动 BASH 脚本中使用 aprun 提交多个 qsub 请求？

Question

具体来说，Cray 需要在 qsub 请求中嵌入一个特殊命令 (aprun) 以在批处理节点上执行作业(Cray 默认在登录/计算节点上运行没有 aprun 语法)。将 qsub 请求手动键入 Cray Linux super 计算机时，定向语法为:

qsub <qsub parameters> -V
aprun -n #CPUS /executable.exe param1 param2 ...
Ctrl-D

用户在 -V(表示在 qsub 语句中传递参数)和可执行文件/参数集之后提供“return”。 Ctrl-D 终止输入并执行 qsub/aprun 命令。

问题是，网上描述了多种在 BASH 脚本中输入 Ctrl-D(即 EOF)的方法，但没有一个它们中的一部分在 qsub 嵌入的 aprun 命令的上下文中工作。

我需要做的是在单个脚本中对多个 qsub/aprun 命令执行相同的语法。我如何在 BASH 中对此进行编码？

Answer 1

解决方案语法是:

qsub <qsub parameters> -V <<EOF 
cd 
aprun -n #CPUS /executable.exe param1 param2 ... 
EOF 

qsub <qsub parameters> -V <<EOF 
cd 
aprun -n #CPUS /executable.exe param1 param2 ... 
EOF 

注意 <<EOF 的位置(<< 和 EOF 之间没有空格)，cd在一个新行上，然后是带有 aprun 的换行符语法和最后的 EOF集合中没有前导<< , 后跟一个换行符。

此语法将执行每个 qsub/aprun命令进入新的批处理节点作业提交。脚本的输出将是请求的作业 ID 系列。