linux - for, do, done 在 linux 中应用将 txt 转换为 biom 格式

Question

我有一个包含许多 txt 文件的文件夹，我想应用 for do do 循环将它们从 txt 转换biom 文件，以下是我所做的:

for txt in folder/*.txt
do biom convert -i $txt -o *.biom --to-hdf5
done

但我得到了一个组合的 biom 文件。

如何修改我上面的代码，将多个 txt 文件更改为 biom 文件，而不更改原始文件名？

比如:test.txt 到 test.biom

Answer 1

下面应该可以解决问题(假设文件名中现在有空格):

for txt in folder/*.txt
do biom convert -i $txt -o  ${txt%.txt}.biom --to-hdf5
done

bash 替换 ${txt%.txt} 去除了变量的 .txt，我们在末尾添加了 .biom。