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我有一个关键算法,其中大部分运行时间都花在计算密集矩阵乘积上:
A*A'*Y, where: A is an m-by-n matrix,
A' is its conjugate transpose,
Y is an m-by-k matrix
Typical characteristics:
- k is much smaller than both m or n (k is typically < 10)
- m in the range [500, 2000]
- n in the range [100, 1000]
基于这些维度,根据matrix chain multiplication的教训问题,很明显,将计算结构化为 A*(A'*Y)
从操作数的角度来看是最优的。我当前的实现就是这样做的,并且仅通过强制表达式的关联性来提高性能是显而易见的。
我的应用程序是用 C++ 为 x86_64 平台编写的。我正在使用 Eigen线性代数库,带有 Intel's Math Kernel Library作为后端。 Eigen 能够使用 IMKL 的 BLAS 接口(interface)执行乘法,并且在我的 Sandy Bridge 机器上从 Eigen 的原生 SSE2 实现迁移到英特尔优化的、基于 AVX 的实现的提升也很重要。
但是,表达式 A * (A.adjoint() * Y)
(用 Eigen 的说法编写)被分解为两个通用矩阵矩阵乘积(调用 xGEMM
BLAS routine),中间创建了一个临时矩阵。我想知道,通过一次评估整个表达式的专门实现,我是否可以获得比我现在拥有的通用实现更快的实现。一些让我相信这一点的观察是:
使用上述典型维度,输入矩阵 A
通常无法放入缓存。因此,用于计算三矩阵乘积的特定内存访问模式将是关键。显然,避免为部分积创建临时矩阵也是有利的。
A
及其共轭转置显然具有非常相关的结构,可以利用该结构改进整个表达式的内存访问模式。
是否有任何标准技术可以以缓存友好的方式实现这种表达式?我发现的大多数矩阵乘法优化技术都是针对标准 A*B
情况,而不是更大的表达式。我对问题的微优化方面很满意,例如转换为适当的 SIMD 指令集,但我正在寻找任何引用资料,以尽可能以对内存最友好的方式分解此结构。
编辑:根据目前收到的回复,我觉得我上面的内容有点不清楚。从我对这个问题的角度来看,我使用 C++/Eigen 的事实实际上只是一个实现细节。 Eigen 在实现表达式模板方面做得很好,但不支持将此类问题评估为简单表达式(仅支持 2 个一般稠密矩阵的乘积)。
在比编译器如何评估表达式更高的层次上,我正在寻找复合乘法运算的更有效的数学分解,旨在避免不必要的冗余内存访问由于 A
的共同结构及其共轭转置。结果可能难以在纯 Eigen 中有效实现,因此我可能只是在具有 SIMD 内在函数的专门例程中实现它。
最佳答案
这不是一个完整的答案(目前 - 我不确定它会成为一个完整的答案)。
让我们先稍微考虑一下数学。由于矩阵乘法是关联的,我们可以做(A*A')Y 或 A(A'*Y)。
(A*A')*Y 的浮点运算
2*m*n*m + 2*m*m*k //the twos come from addition and multiplication
A*(A'*Y) 的浮点运算
2*m*n*k + 2*m*n*k = 4*m*n*k
因为 k 比 m 和 n 小得多,所以很清楚为什么第二种情况要快得多。
但是通过对称性,原则上我们可以将 A*A' 的计算次数减少两次(尽管这对于 SIMD 可能不容易做到)因此我们可以减少 (A*A' )*Y 到
m*n*m + 2*m*m*k.
我们知道 m 和 n 都大于 k。让我们为 m 和 n 选择一个名为 z
的新变量,找出情况一和情况二相等的地方:
z*z*z + 2*z*z*k = 4*z*z*k //now simplify
z = 2*k.
只要 m 和 n 都大于 k 的两倍,第二种情况的浮点运算就会更少。在您的情况下,m 和 n 均大于 100,而 k 小于 10,因此情况二使用的浮点运算要少得多。
在高效代码方面。如果代码针对缓存的有效使用进行了优化(如 MKL 和 Eigen),那么大型密集矩阵乘法是计算限制而不是内存限制,因此您不必担心缓存。 MKL 比 Eigen 快,因为 MKL 使用 AVX(现在可能还有 fma3?)。
我不认为你能够比你已经使用第二种情况和 MKL(通过 Eigen)更有效地做到这一点。启用 OpenMP 以获得最大的 FLOPS。
您应该通过将 FLOPS 与处理器的峰值 FLOPS 进行比较来计算效率。假设您有一个 Sandy Bridge/Ivy Bridge 处理器。峰值 SP FLOPS 是
frequency * number of physical cores * 8 (8-wide AVX SP) * 2 (addition + multiplication)
对于双进动除以二。如果您有 Haswell,而 MKL 使用 FMA,则将峰值 FLOPS 加倍。要获得正确的频率,您必须对所有内核使用涡轮增压值(它低于单个内核)。如果您没有对系统进行超频,或者在 Windows 上使用 CPU-Z 或在 Linux 上使用 Powertop(如果您有超频系统),则可以查看此内容。
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我是一名优秀的程序员,十分优秀!