python - 在 cmd 中通过 Python 运行工具不等待

Question

我在 cmd 中通过 Python 运行一个工具。对于给定目录中的每个样本，我希望该工具做一些事情。但是，当我在循环中使用 process = subprocess.Popen(command) 时，命令不会等到它完成，导致一次出现 10 个提示。当我使用 subprocess.Popen(command, stdout=subprocess.PIPE) 时，命令仍然是黑色，我看不到进度，尽管它会等到命令完成。

有没有人知道如何通过 cmd 中的 Python 调用外部工具，它会等到命令完成并且能够显示进度cmd 中的工具？

#main.py
        for sample in os.listdir(os.getcwd()):
            if ".fastq" in sample and '_R1_' in sample and "Temp" not in sample:
                print time.strftime("%H:%M:%S")
                DNA_Bowtie2.DNA_Bowtie2(os.getcwd()+'\\'+sample+'\\'+sample)

#DNA_Bowtie2.py
            # Run Bowtie2 command and wait for process to be finished.
            process = subprocess.Popen(command, stdout=subprocess.PIPE)
            process.wait()
            process.stdout.read()

编辑:command = perl 或 java 命令。通过上述化妆，我看不到工具输出，因为提示符(perl 窗口或 java 窗口)仍然是黑色的。

Answer 1

看起来你的子进程 fork 了，否则 wait() 不可能在进程完成之前返回。