java - 复制文件时出现静默错误

Question

我有以下复制文件的方法:

public static void nioCopy(File source, File destination) {
    FileInputStream fis = null;
    FileOutputStream fos = null;
    FileChannel input = null;
    FileChannel output = null;
    try {
        fis = new FileInputStream(source);
        fos = new FileOutputStream(destination);

         input = fis.getChannel();
         output = fos.getChannel();

        input.transferTo(0, input.size(), output);

    } catch (FileNotFoundException ex) {
        Logger.getLogger(Utilities.class.getName()).log(Level.SEVERE, "Can't find either of input/output files.", ex);
    } catch (IOException ex) {
        Logger.getLogger(Utilities.class.getName()).log(Level.SEVERE, "Can't open either of input/output file for reading/writing", ex);
    } finally {
        try {
            fis.close();
            fos.close();
            input.close();
            output.close();
        } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(Utilities.class.getName()).log(Level.SEVERE, "Error closing streams", ex);
        }

    }
}

我正在使用复制文件，但有时我会收到无声错误或未定义的行为，或者我只是不知道如何解释它，这就是我得到的:

这是我的来源:

-rw-r--r-- 1 nb9 team92 3.1G 2011-10-13 16:31 6443_6#5_1_6443_6#5_2.fastq.f.fq.gz

这是目的地:

-rw-r--r-- 1 nb9 team92 2.0G 2011-10-13 16:49 6443_6#5_1_6443_6#5_2.fastq.f.fq.gz

在执行此过程时我没有发现任何异常，从外观上看一切都应该成功，但是当我开始解压缩文件时我得到:

java.io.EOFException: ZLIB 输入流的意外结束

很明显，目的地比原始标记低 1 gig。

唯一的特点是这两个文件都在一个非常繁忙的 lustre 文件系统上，这可能是在做一些有趣的事情吗？

Answer 1

在 2Gb 处被截断的事实让我产生了怀疑。我搜索了一下，它看起来像 issue with nio .也可能是目标文件系统允许最大 2Gb 文件。

来自 Java NIO: Buffers

At present, buffer sizes are limited to 2GB (the maximum positive number that can be represented in an int. An updated planned for Java 7 will allow large buffers (with the size and indexes held as a long).

无论如何，只是为了确定:

• 如果你有空间，你能试着把它复制到同一个文件系统上吗？
• 你能试试 Apache Commons IO FileUtils.copyFile() ？似乎他们 fixed this issue .
• 如果可以升级，请尝试使用 Java 7，因为它已经发布了