php - lattice levelplot 仅在 RApache 下失败

Question

我正在开发一个通过 curl 和 RApache 调用 R 的 PHP 网络应用程序。大多数事情都很好。但是一个格子图会抛出这个错误:

RApache Warning/Error!!!Error in uy + c(-1, 1) : non-numeric argument to binary operator

我尝试保存输入绘图的数据结构并在我的本地 R 中绘制绘图，但绘图工作正常。所以我无法复制错误。

这些是脚本在 RApache 中运行时加载的库:

library(Brew)
library(Cairo)
library(rjson)
library(DBI)
library(RMySQL)
library(reshape)
library(plyr)
library('RColorBrewer')
library(ggplot2)
library(lattice)
library(latticeExtra)
library(hexbin)

这是脚本的一部分:

colgrad.pal<-colorRampPalette(brewer.pal(11,'Spectral'), interpolate='spline')

//problem plot
dists.med.lplot<-levelplot(value~starttime+groupname|dists, data=MDist.median,
  col.regions=rev(colgrad.pal(200)),colorkey=list(col=rev(colgrad.pal(200))),
  xlab='Time(s)',ylab='Treatment',
  main='Level Plot of Median Distance',
  layout=c(1,3))

这里是一个数据文件的链接。我是这样读的://链接看起来不可信，所以删除了

数据看起来像这样:

'data.frame':   2880 obs. of  6 variables:
 $ groupname: Factor w/ 8 levels "rowA","rowB",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ fCycle   : Factor w/ 6 levels "Cycle 1","Cycle 2",..: 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 ...
 $ fPhase   : Factor w/ 2 levels "Dark","Light": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ starttime: int  0 60 120 180 240 300 360 420 480 540 ...
 $ dists    : Factor w/ 3 levels "inadist","lardist",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ value    : num  47.5 64 78.3 39.2 53.7 ...

关于问题是什么或如何更好地解决这个问题有什么想法吗？

ETA 版本/平台信息

        [platform] => sparc-sun-solaris2.10
        [arch] => sparc
        [os] => solaris2.10
        [system] => sparc, solaris2.10
        [status] => 
        [major] => 2
        [minor] => 10.1
        [year] => 2009
        [month] => 12
        [day] => 14
        [svn rev] => 50720
        [language] => R
        [version.string] => R version 2.10.1 (2009-12-14)

Answer 1

错误闻起来像是您的数据有问题。我会尝试以下操作:

• 在实际调用 plot() 等之前，通过 save(x, y, z, ..., file="/tmp/dbg.RData")
• 然后在“正常”R session 中从保存的文件中加载所有相关数据并检查和比较
• 这应该允许您查明数据问题，然后您可以通过更多的健全性检查等来规避该问题，以防止您的实际代码崩溃。