sql - 实现关系数据模型 : what are the constraints for this table?

Question

我正在尝试提出一个关系模型和数据库实现，但一直遇到这个问题。但我什至不知道该怎么调用它!改进标题的建议将不胜感激。

我试图将问题归结为基础。

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简化示例:

这是 MySQLWorkbench 图表:

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如您所见，问题都出在 Atom 表上。

期望目标的概述:

• 我需要存储蛋白质特定原子的数据
• 我可能有一些原子的数据，或者没有原子的数据
• 我不想插入垃圾数据——我希望数据库约束能够防止这种情况发生

我不确定的是:

• 是否应该有一个Atom 表——似乎Atom_ref 和Residue 之间的连接会生成蛋白质的所有原子-- 但我还需要存储有关原子的数据

问题概要:

• 每个原子需要一个残基和一个atom_ref
• 但由于残基与 residue_ref 关联，atom_ref 只能是关联的(与 residue_ref)atom_ref 之一
• 不知道如何匹配 Residue 的 residue_ref 和 atom_ref 的 residue_ref

到目前为止我尝试了什么:

• 将 Atom_ref 的 pk 添加到 Atom 的 pk - 但 residue_ref 可能与 Residue 的不匹配
• 将 Residue.rr_name 更改为 pk 的一部分——违反域语义

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我知道这对问题的解释很糟糕，我正在努力弄清楚如何更清楚地解释它!非常欢迎提出改进建议!

Answer 1

如果我对您的理解正确，那么您所追求的是 (a) Atom 和 Residue 的连接与 (b) Atom_ref 之间的包含依赖关系。 (即 Atom 中的所有原子名，与在 residue 中为其定义的 rr_name 组合，必须声明为有效组合，即必须出现在 Atomref 中)。

仅使用 RI/FK 的方法是在 Atom 中冗余地包含 rr_name。将 FK 从 Atom 扩展到 Residue 到所有三列。这将保证你在 Atom 中记录的 rr_names 与 Residue 中的信息保持一致。但是由于您现在已经在 Atom 中引入了 rr_name，您现在可以确保(通过 FK atomname+rrname 从 Atom 到 Atom_ref)Atom 中记录的任何内容也与已声明的原子名一致(在 atomref 中)存在于所涉及的 residueref。

请注意，此“解决方案”使更新数据库变得更加困难(需要维护更多冗余，从而增加违规的可能性)，因为您刚刚降低了设计的 NF 级别。

另一种方法是让您的设计保持原样，并通过适当的触发器对每个涉及的表强制执行约束，其中更新可能会导致违反您的业务规则。那将是，在 Atom_ref 上删除和更新(即任何导致某处有效组合消失的东西)，在 Residue 上更新(rr_name)，以及在 Atom 上插入和更新(即任何可能导致某些东西出现的东西)可能无效的组合)。