python - 如何使用 readline() 从第二行开始？

Question

我正在用 Python 编写一个简短的程序，它将读取通常采用这种格式的 FASTA 文件:

>gi|253795547|ref|NC_012960.1| Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome, 52 lines
GACGGCTTGTTTGCGTGCGACGAGTTTAGGATTGCTCTTTTGCTAAGCTTGGGGGTTGCGCCCAAAGTGA
TTAGATTTTCCGACAGCGTACGGCGCGCGCTGCTGAACGTGGCCACTGAGCTTACACCTCATTTCAGCGC
TCGCTTGCTGGCGAAGCTGGCAGCAGCTTGTTAATGCTAGTGTTGGGCTCGCCGAAAGCTGGCAGGTCGA

我创建了另一个程序来读取该 FASTA 文件的第一行(也称为标题)，现在我希望第二个程序从序列开始读取和打印。

我该怎么做？

到目前为止我有这个:

FASTA = open("test.txt", "r")

def readSeq(FASTA):
    """returns the DNA sequence of a FASTA file"""
    for line in FASTA:
        line = line.strip()
        print line          


readSeq(FASTA)

谢谢大家

-菜鸟

Answer 1

def readSeq(FASTA):
    """returns the DNA sequence of a FASTA file"""
    _unused = FASTA.next() # skip heading record
    for line in FASTA:
        line = line.strip()
        print line  

阅读the docs on file.next()看看为什么你应该警惕混合 file.readline() 和 for line in file: