python - biopython 有没有办法从发表的文章中获取完整的摘要？

Question

我目前有以下查询 pubmed 的代码:

from Bio import Entrez
Entrez.email = "kuharrw@hiram.edu"     # Always tell NCBI who you are
handle = Entrez.esearch(db="pubmed", term="bacteria")
record = Entrez.read(handle)
list = record["IdList"]
print len(list)
for index in range(0, len(list)):
    listId = list[index]
    handle = Entrez.esummary(db="pubmed", id=listId)
    record = Entrez.read(handle)
    print index
    print record[0]["Title"]
    print record[0]["HasAbstract"]

此代码能够告诉我文章是否有摘要，但我找不到任何关于如何实际返回摘要的文档。是否可以使用 biopython？如果不是，还有其他方法吗？

Answer 1

是的，使用 BioPython 显然是可能的。如果您完全按照本节进行操作，您应该能够从 pubmed 获得摘要:http://www.biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html#sec142

如果您觉得此链接没有帮助，请告诉我。我会尽快回复您。