python - numpy 的平均值大于 memmap 的最大值

Question

我有一个时间戳数组，矩阵 X 的第 2 列中的每一行都递增。我计算了时间戳的平均值，它大于最大值。我正在使用 numpy memmap 进行存储。为什么会这样？

>>> self.X[:,1]
memmap([  1.45160858e+09,   1.45160858e+09,   1.45160858e+09, ...,
     1.45997146e+09,   1.45997683e+09,   1.45997939e+09], dtype=float32)
>>> np.mean(self.X[:,1])
1.4642646e+09
>>> np.max(self.X[:,1])
memmap(1459979392.0, dtype=float32)
>>> np.average(self.X[:,1])
1.4642646e+09
>>> self.X[:,1].shape
(873608,)
>>> np.sum(self.X[:,1])
memmap(1279193195216896.0, dtype=float32)
>>> np.sum(self.X[:,1]) / self.X[:,1].shape[0]
memmap(1464264515.9120522)

编辑:我已经在这里上传了 memmap 文件。 http://www.filedropper.com/x_2这就是我加载它的方式。

filepath = ...
shape = (875422, 23)
X = np.memmap(filepath, dtype="float32", mode="r", shape=shape)

# I preprocess X by removing rows with all 0s
# note this step doesn't affect the problem
to_remove = np.where(np.all(X == 0, axis=1))[0]
X = np.delete(X, to_remove, axis=0)

Answer 1

这不是 numpy 或 memmap 问题。问题在于 float ，准确地说是 float32。您可以在 C++ 等其他语言中看到同样的错误。

随着越来越多的数字被添加到其中，使用的 float32 累加器变得不精确。

In [26]: a = np.ones((1024,1024), dtype=np.float32)*4567

In [27]: a.min()
Out[27]: 4567.0

In [28]: a.max()
Out[28]: 4567.0

In [29]: a.mean()
Out[29]: 4596.5264

这不会发生在 np.float64 类型中(提供更多的喘息空间)。

In [30]: a = np.ones((1024,1024), dtype=np.float64)*4567

In [31]: a.min()
Out[31]: 4567.0

In [32]: a.mean()
Out[32]: 4567.0

您可以通过明确指定 mean() 使用 float64 缓冲区。

In [12]: a = np.ones((1024,1024), dtype=np.float32)*4567

In [13]: a.mean(dtype=np.float64)
Out[13]: 4567.0