python - 具有稀疏矩阵的matshow

Question

如何可视化大型稀疏矩阵的稀疏模式？

矩阵太大，无法作为密集数组放入内存，因此我采用 csr_matrix 格式。当我用它尝试 pylab 的 matshow 时，出现以下错误:

ValueError: 需要多于 0 个值才能解压

想法？

例如:

import pylab as pl
import scipy.sparse as sp
from random import randint

mat = sp.lil_matrix( (4000,3000), dtype='uint8' )
for i in range(1000):
    mat[randint(0,4000),randint(0,3000)] = randint(0,10)

pl.figure()
pl.matshow(mat)

Answer 1

matshow 适用于密集数组。对于稀疏数组，您可以使用 spy:

import scipy.sparse as sps
import matplotlib.pyplot as plt

a = sps.rand(1000, 1000, density=0.001, format='csr')

plt.spy(a)
plt.show()