python - 从图形工具中的邻接矩阵创建加权图，python 接口(interface)

Question

我应该如何使用 python 中的图形工具从邻接矩阵中创建图形？假设我们有 adj 矩阵作为邻接矩阵。

我现在的做法是这样的:

        g = graph_tool.Graph(directed = False)
        g.add_vertex(len(adj))
        edge_weights = g.new_edge_property('double')
        for i in range(adj.shape[0]):
            for j in range(adj.shape[1]):
                if i > j and adj[i,j] != 0:
                    e = g.add_edge(i, j)
                    edge_weights[e] = adj[i,j]

但是感觉不对，我们有什么更好的解决方案吗？

(我猜一个合适的标签是 graph-tool，但我不能添加它，一些有足够权限的好心人可以制作标签？)

Answer 1

图形工具现在包含一个向图形添加边列表的功能。你现在可以做，例如:

import graph_tool as gt
import numpy as np
g = gt.Graph(directed=False)
adj = np.random.randint(0, 2, (100, 100))
g.add_edge_list(np.transpose(adj.nonzero()))