python - networkx 与 matplotlib 的交互

Question

我正在 matplotlib 中尝试 networkx 和可视化，我很困惑，因为我不清楚它们是如何相互作用的？有简单的例子

import matplotlib.pyplot
import networkx as nx
G=nx.path_graph(8)
nx.draw(G)
matplotlib.pyplot.show()

我在哪里告诉 pyplot，我想绘制图 G？我猜 nx.draw 使用类似 matplotlib.pyplot.{plot, etc ...}所以，如果我想画 2 个图:

import matplotlib.pyplot
import networkx as nx

G=nx.path_graph(8)
E=nx.path_graph(30)
nx.draw(G)

matplotlib.pyplot.figure()
nx.draw(E)
matplotlib.pyplot.show()

然后……小实验

import networkx as nx
G=nx.path_graph(8)
E=nx.path_graph(30)
nx.draw(G)
import matplotlib.pyplot
matplotlib.pyplot.figure()
nx.draw(E)
import matplotlib.pyplot as plt
plt.show()

请不要因为这个愚蠢的代码而杀了我，我只是想了解 - networkx 如何绘制一些 matplotlib，而它甚至还没有导入!

P.S:对不起我的英语。

Answer 1

如果您想单独绘制图形或创建单个 Axes 对象并将其传递给 nx.draw，只需创建两个不同的轴。例如:

G = nx.path_graph(8)
E = nx.path_graph(30)

# one plot, both graphs
fig, ax = subplots()
nx.draw(G, ax=ax)
nx.draw(E, ax=ax)

得到:

如果您想要两个不同的图形对象，则分别创建它们，如下所示:

G = nx.path_graph(8)
E = nx.path_graph(30)

# two separate graphs
fig1 = figure()
ax1 = fig1.add_subplot(111)
nx.draw(G, ax=ax1)

fig2 = figure()
ax2 = fig2.add_subplot(111)
nx.draw(G, ax=ax2)

产量:

最后，如果需要，您可以创建一个子图，如下所示:

G = nx.path_graph(8)
E = nx.path_graph(30)

pos=nx.spring_layout(E,iterations=100)

subplot(121)
nx.draw(E, pos)

subplot(122)
nx.draw(G, pos)

导致:

无论它的值(value)如何，nx.draw 的 ax 参数对于 matplotlib 的 API 来说都是无用的当你想要在 pylab 之外创建子图，因为 nx.draw 有一些对 gca 的调用，这使得它依赖于 pylab 界面。没有真正深入了解这是为什么，只是想我会指出来。

nx.draw 的源代码非常简单:

try:
    import matplotlib.pylab as pylab
except ImportError:
    raise ImportError("Matplotlib required for draw()")
except RuntimeError:
    print("Matplotlib unable to open display")
    raise

cf=pylab.gcf()
cf.set_facecolor('w')
if ax is None:
    if cf._axstack() is None:
        ax=cf.add_axes((0,0,1,1))
    else:
        ax=cf.gca()

# allow callers to override the hold state by passing hold=True|False

b = pylab.ishold()
h = kwds.pop('hold', None)
if h is not None:
    pylab.hold(h)
try:
    draw_networkx(G,pos=pos,ax=ax,**kwds)
    ax.set_axis_off()
    pylab.draw_if_interactive()
except:
    pylab.hold(b)
    raise
pylab.hold(b)
return

1. 使用 gcf 从环境中捕获图形。
2. 然后将 Axes 对象添加到图中(如果不存在)，否则使用 gca 从环境中获取它。
3. 将绘图面颜色设为白色
4. 开启保持
5. 用内部函数绘制
6. 关闭轴
7. 最后，如果我们处于交互模式，绘制它并重新引发捕获到的任何异常