python - pandas DataFrame.to_string() 从列中截断字符串

Question

当我尝试使用 to_string 从 dataframe 输出列时，它会截断该列的输出。

print gtf_df.ix[:1][['transcript_id','attributes']].to_string(header=False,index=False)

Out: ' CUFF.1.1  gene_id "CUFF.1"; transcript_id "CUFF.1.1"; FPKM '

print gtf_df.ix[:1]['attributes'][0]

Out: 'gene_id "CUFF.1"; transcript_id "CUFF.1.1"; FPKM "1670303.8168650887"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "5010911.450595"; cov "9658.694354";'

关于如何解决这个问题有什么想法吗？谢谢!

Answer 1

使用 __repr__ 或 to_string 列默认截断为 50 个字符。在 0.13.1 之前的 Pandas 版本中，这可以使用 pandas.set_printoptions() 控制:

In [64]: df
Out[64]:
                                                   A    B
a  this is a very long string, longer than the defau  bar
b                                                foo  baz

In [65]: pandas.set_printoptions(max_colwidth=100)

In [66]: df
Out[66]:
                                                                      A    B
a  this is a very long string, longer than the default max_column width  bar
b                                                                   foo  baz

在较新版本的 Pandas 中，请改用它:

pd.options.display.max_colwidth = 100