- c - 在位数组中找到第一个零
- linux - Unix 显示有关匹配两种模式之一的文件的信息
- 正则表达式替换多个文件
- linux - 隐藏来自 xtrace 的命令
我正在编写实现随机生成算法的代码,以从正态分布的尾部进行采样 proposed by Christian Robert .问题是,虽然 R 中的代码可以正常工作,但如果失败,则在将其转换为 C++ 之后。我看不出有任何原因,如果能向我解释出了什么问题以及原因,我将不胜感激。
请注意,下面的代码远谈不上优雅和高效,它经过简化以制作可重现的示例。
这是 R 中的函数:
rtnormR <- function(mean = 0, sd = 1, lower = -Inf, upper = Inf) {
lower <- (lower - mean) / sd
upper <- (upper - mean) / sd
if (lower < upper && lower >= 0) {
while (TRUE) {
astar <- (lower + sqrt(lower^2 + 4)) / 2
z <- rexp(1, astar) + lower
u <- runif(1)
if ((u <= exp(-(z - astar)^2 / 2)) && (z <= upper)) break
}
} else {
z <- NaN
}
z*sd + mean
}
这里是 C++ 版本:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
double rtnormCpp(double mean, double sd, double lower, double upper) {
double z_lower = (lower - mean) / sd;
double z_upper = (upper - mean) / sd;
bool stop = false;
double astar, z, u;
if (z_lower < z_upper && z_lower >= 0) {
while (!stop) {
astar = (z_lower + std::sqrt(std::pow(z_lower, 2) + 4)) / 2;
z = R::exp_rand() * astar + z_lower;
u = R::unif_rand();
if ((u <= std::exp(-std::pow(z-astar, 2) / 2)) && (z <= z_upper))
stop = true;
}
} else {
z = NAN;
}
return z*sd + mean;
}
现在比较使用这两个函数获得的样本(它们与来自 msm 库的 dtnorm
函数进行比较):
xx = seq(-6, 6, by = 0.001)
hist(replicate(5000, rtnormR(mean = 0, sd = 1, lower = 3, upper = 5)), freq= FALSE, ylab = "", xlab = "", main = "rtnormR")
lines(xx, msm::dtnorm(xx, mean = 0, sd = 1, lower = 3, upper = 5), col = "red")
hist(replicate(5000, rtnormCpp(mean = 0, sd = 1, lower = 3, upper = 5)), freq= FALSE, ylab = "", xlab = "", main = "rtnormCpp")
lines(xx, msm::dtnorm(xx, mean = 0, sd = 1, lower = 3, upper = 5), col = "red")
如您所见,rtnormCpp
返回有偏差的样本。你知道为什么吗?
最佳答案
虽然可以在 rexp()
中使用 scale
或 rate
,但默认参数化是 rate
-所以 rexp(1,astar)
的平均值是 1/astar
,而不是 astar
。
如果将相关的C++代码行改为
z = R::exp_rand() / astar + z_lower;
似乎一切正常。
关于c++ - 从 R 翻译的随机生成代码在 C++ 中失败,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/39937139/
我正在从 Stata 迁移到 R(plm 包),以便进行面板模型计量经济学。在 Stata 中,面板模型(例如随机效应)通常报告组内、组间和整体 R 平方。 I have found plm 随机效应
关闭。这个问题不符合Stack Overflow guidelines .它目前不接受答案。 想改进这个问题?将问题更新为 on-topic对于堆栈溢出。 6年前关闭。 Improve this qu
我想要求用户输入整数值列表。用户可以输入单个值或一组多个值,如 1 2 3(spcae 或逗号分隔)然后使用输入的数据进行进一步计算。 我正在使用下面的代码 EXP <- as.integer(rea
当 R 使用分类变量执行回归时,它实际上是虚拟编码。也就是说,省略了一个级别作为基础或引用,并且回归公式包括所有其他级别的虚拟变量。但是,R 选择了哪一个作为引用,以及我如何影响这个选择? 具有四个级
这个问题基本上是我之前问过的问题的延伸:How to only print (adjusted) R-squared of regression model? 我想建立一个线性回归模型来预测具有 15
我在一台安装了多个软件包的 Linux 计算机上安装了 R。现在我正在另一台 Linux 计算机上设置 R。从他们的存储库安装 R 很容易,但我将不得不使用 安装许多包 install.package
我正在阅读 Hadley 的高级 R 编程,当它讨论字符的内存大小时,它说: R has a global string pool. This means that each unique strin
我们可以将 Shiny 代码写在两个单独的文件中,"ui.R"和 "server.R" , 或者我们可以将两个模块写入一个文件 "app.R"并调用函数shinyApp() 这两种方法中的任何一种在性
我正在使用 R 通过 RGP 包进行遗传编程。环境创造了解决问题的功能。我想将这些函数保存在它们自己的 .R 源文件中。我这辈子都想不通怎么办。我尝试过的一种方法是: bf_str = print(b
假设我创建了一个函数“function.r”,在编辑该函数后我必须通过 source('function.r') 重新加载到我的全局环境中。无论如何,每次我进行编辑时,我是否可以避免将其重新加载到我的
例如,test.R 是一个单行文件: $ cat test.R # print('Hello, world!') 我们可以通过Rscript test.R 或R CMD BATCH test.R 来
我知道我可以使用 Rmd 来构建包插图,但想知道是否可以更具体地使用 R Notebooks 来制作包插图。如果是这样,我需要将 R Notebooks 编写为包小插图有什么不同吗?我正在使用最新版本
我正在考虑使用 R 包的共享库进行 R 的站点安装。 多台计算机将访问该库,以便每个人共享相同的设置。 问题是我注意到有时您无法更新包,因为另一个 R 实例正在锁定库。我不能要求每个人都关闭它的 R
我知道如何从命令行启动 R 并执行表达式(例如, R -e 'print("hello")' )或从文件中获取输入(例如, R -f filename.r )。但是,在这两种情况下,R 都会运行文件中
我正在尝试使我当前的项目可重现,因此我正在创建一个主文档(最终是一个 .rmd 文件),用于调用和执行其他几个文档。这样我自己和其他调查员只需要打开和运行一个文件。 当前设置分为三层:主文件、2 个读
关闭。这个问题不符合Stack Overflow guidelines .它目前不接受答案。 想改进这个问题?将问题更新为 on-topic对于堆栈溢出。 5年前关闭。 Improve this qu
我的 R 包中有以下描述文件 Package: blah Title: What the Package Does (one line, title case) Version: 0.0.0.9000
有没有办法更有效地编写以下语句?accel 是一个数据框。 accel[[2]]<- accel[[2]]-weighted.mean(accel[[2]]) accel[[3]]<- accel[[
例如,在尝试安装 R 包时 curl作为 usethis 的依赖项: * installing *source* package ‘curl’ ... ** package ‘curl’ succes
我想将一些软件作为一个包共享,但我的一些脚本似乎并不能很自然地作为函数运行。例如,考虑以下代码块,其中“raw.df”是一个包含离散和连续类型变量的数据框。函数“count.unique”和“squa
我是一名优秀的程序员,十分优秀!