- c - 在位数组中找到第一个零
- linux - Unix 显示有关匹配两种模式之一的文件的信息
- 正则表达式替换多个文件
- linux - 隐藏来自 xtrace 的命令
我正在尝试绘制干草叉 fork 随时间的发展。 x 和 y 之间的关系开始时近似线性,但最终呈 S 形 S 形状。最终关系不是函数; x 的某些值有多个 y 值。
Matplotlib 为曲面图做了很好的线框,但这些曲面图似乎无法处理非函数。
有没有另一种方法来描绘这种关系的表面? (如果可能的话,我不想要一个实心的形状。)
目前我的数据在零数组中,其中 1
表示表面位置的近似值。我已经包含了一个非常小的示例数据集,以及将绘制它们位置的示例代码。我如何“连接点”?
我的实际数据集更大(500x200x200)且种类繁多,因此我需要开发一个灵活的系统。
这就是最终数字可能的样子:
来自 reading mplot3d
documentation here看来我可能需要将我的数据转换为二维数组。如果是这种情况,请您提供一种方法,如果可能的话,请告诉我这些数组代表什么。
我非常感谢任何能插入这一点的评论/建议。
import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt
sample_data = np.array([
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]]
] )
XS, YS, ZS = [],[],[]
for g in xrange(np.shape(sample_data)[0]):
for row in xrange(np.shape(sample_data)[1]):
for col in xrange(np.shape(sample_data)[2]):
if sample_data[g][row][col] == 1:
XS.append(g)
YS.append(col)
ZS.append(row)
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
ax.scatter(XS, YS, ZS)
plt.show()
最佳答案
根据 mrcl 的建议,要在 matplotlib 中执行此操作,您可以使用 trisurf
。但是,您必须提供自己的三角形,因为 Delaunay 不适用于您的点的二维投影。
要构建三角剖分,我建议构建您的表面的参数表示(根据 s、t)并在空间 (s , t).
它会给出这样的东西
基于您下面的代码的示例(由于您的数据非常粗糙,我添加了一些插值):
import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.tri as mtri
from matplotlib import cm
sample_data = np.array([
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]],
[[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 1., 1., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 1., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]]
] )
XS, YS, ZS = [],[],[]
for g in xrange(np.shape(sample_data)[0]):
for row in xrange(np.shape(sample_data)[1]):
for col in xrange(np.shape(sample_data)[2]):
if sample_data[g][row][col] == 1:
XS.append(g)
YS.append(col)
ZS.append(row)
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
ax.scatter(XS, YS, ZS)
XS = np.asarray(XS)
YS = np.asarray(YS)
ZS = np.asarray(ZS)
def re_ordinate(x, y):
ord = np.arange(np.shape(x)[0])
iter = True
itermax = 10
n_iter = 0
while iter and n_iter < itermax:
n_iter += 1
dist1 = (x[0:-2] - x[1:-1])**2 + (y[0:-2] - y[1:-1])**2
dist2 = (x[0:-2] - x[2:])**2 + (y[0:-2] - y[2:])**2
swap = np.argwhere(dist2 < dist1)
for s in swap:
s += 1
t = x[s]
x[s] = x[s+1]
x[s+1] = t
t = y[s]
y[s] = y[s+1]
y[s+1] = t
t = ord[s]
ord[s] = ord[s+1]
ord[s+1] = t
return ord / float(np.size(ord, 0))
# Building parametrisation of the surface
s = np.zeros(np.shape(XS)[0])
t = np.zeros(np.shape(XS)[0])
begin = 0
end = 0
for g in xrange(np.shape(sample_data)[0]):
cut = np.argwhere(XS==g).flatten()
begin = end
end += np.size(cut, 0)
X_loc = XS[cut]
Y_loc = YS[cut]
Z_loc = ZS[cut]
s[begin: end] = g / float(np.size(sample_data, 0))
t[begin: end] = re_ordinate(Y_loc, Z_loc)
#ax.plot(X_loc, Y_loc, Z_loc, color="grey")
triangles = mtri.Triangulation(s, t).triangles
refiner = mtri.UniformTriRefiner(mtri.Triangulation(s, t))
subdiv = 2
_, x_refi = refiner.refine_field(XS, subdiv=subdiv)
_, y_refi = refiner.refine_field(YS, subdiv=subdiv)
triang_param, z_refi = refiner.refine_field(ZS, subdiv=subdiv)
#triang_param = refiner.refine_triangulation()#mtri.Triangulation(XS, YS, triangles)
#print triang_param.triangles
triang = mtri.Triangulation(x_refi, y_refi, triang_param.triangles)
ax.plot_trisurf(triang, z_refi, cmap=cm.jet, lw=0.)
plt.show()
关于python - 如何在 matplotlib 中绘制滞后现象?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/22219450/
我需要将文本放在 中在一个 Div 中,在另一个 Div 中,在另一个 Div 中。所以这是它的样子: #document Change PIN
奇怪的事情发生了。 我有一个基本的 html 代码。 html,头部, body 。(因为我收到了一些反对票,这里是完整的代码) 这是我的CSS: html { backgroun
我正在尝试将 Assets 中的一组图像加载到 UICollectionview 中存在的 ImageView 中,但每当我运行应用程序时它都会显示错误。而且也没有显示图像。 我在ViewDidLoa
我需要根据带参数的 perl 脚本的输出更改一些环境变量。在 tcsh 中,我可以使用别名命令来评估 perl 脚本的输出。 tcsh: alias setsdk 'eval `/localhome/
我使用 Windows 身份验证创建了一个新的 Blazor(服务器端)应用程序,并使用 IIS Express 运行它。它将显示一条消息“Hello Domain\User!”来自右上方的以下 Ra
这是我的方法 void login(Event event);我想知道 Kotlin 中应该如何 最佳答案 在 Kotlin 中通配符运算符是 * 。它指示编译器它是未知的,但一旦知道,就不会有其他类
看下面的代码 for story in book if story.title.length < 140 - var story
我正在尝试用 C 语言学习字符串处理。我写了一个程序,它存储了一些音乐轨道,并帮助用户检查他/她想到的歌曲是否存在于存储的轨道中。这是通过要求用户输入一串字符来完成的。然后程序使用 strstr()
我正在学习 sscanf 并遇到如下格式字符串: sscanf("%[^:]:%[^*=]%*[*=]%n",a,b,&c); 我理解 %[^:] 部分意味着扫描直到遇到 ':' 并将其分配给 a。:
def char_check(x,y): if (str(x) in y or x.find(y) > -1) or (str(y) in x or y.find(x) > -1):
我有一种情况,我想将文本文件中的现有行包含到一个新 block 中。 line 1 line 2 line in block line 3 line 4 应该变成 line 1 line 2 line
我有一个新项目,我正在尝试设置 Django 调试工具栏。首先,我尝试了快速设置,它只涉及将 'debug_toolbar' 添加到我的已安装应用程序列表中。有了这个,当我转到我的根 URL 时,调试
在 Matlab 中,如果我有一个函数 f,例如签名是 f(a,b,c),我可以创建一个只有一个变量 b 的函数,它将使用固定的 a=a1 和 c=c1 调用 f: g = @(b) f(a1, b,
我不明白为什么 ForEach 中的元素之间有多余的垂直间距在 VStack 里面在 ScrollView 里面使用 GeometryReader 时渲染自定义水平分隔线。 Scrol
我想知道,是否有关于何时使用 session 和 cookie 的指南或最佳实践? 什么应该和什么不应该存储在其中?谢谢! 最佳答案 这些文档很好地了解了 session cookie 的安全问题以及
我在 scipy/numpy 中有一个 Nx3 矩阵,我想用它制作一个 3 维条形图,其中 X 轴和 Y 轴由矩阵的第一列和第二列的值、高度确定每个条形的 是矩阵中的第三列,条形的数量由 N 确定。
假设我用两种不同的方式初始化信号量 sem_init(&randomsem,0,1) sem_init(&randomsem,0,0) 现在, sem_wait(&randomsem) 在这两种情况下
我怀疑该值如何存储在“WORD”中,因为 PStr 包含实际输出。? 既然Pstr中存储的是小写到大写的字母,那么在printf中如何将其给出为“WORD”。有人可以吗?解释一下? #include
我有一个 3x3 数组: var my_array = [[0,1,2], [3,4,5], [6,7,8]]; 并想获得它的第一个 2
我意识到您可以使用如下方式轻松检查焦点: var hasFocus = true; $(window).blur(function(){ hasFocus = false; }); $(win
我是一名优秀的程序员,十分优秀!