python - 从 makefile 激活 Anaconda Python 环境

Question

我想使用 makefile 来构建我的项目环境，使用 makefile 和 anaconda/miniconda ，所以我应该能够克隆 repo 并简单地运行 make myproject

myproject: build

build:
  @printf "\nBuilding Python Environment\n"
  @conda env create --quiet --force --file environment.yml
  @source /home/vagrant/miniconda/bin/activate myproject

但是，如果我尝试这样做，我会收到以下错误

make: source: Command not found

make: *** [source] Error 127

我已经搜索了一个解决方案，但是 [这个问题/答案 ( How to source a script in a Makefile? ) 表明我不能在 makefile 中使用 source。

This answer , 然而，提出了一个解决方案(并收到了一些赞成票)但这对我也不起作用

( \
source /home/vagrant/miniconda/bin/activate myproject; \

)

/bin/sh: 2: source: not found

make: *** [source] Error 127

我还尝试将 source activate 步骤移动到一个单独的 bash 脚本，并从 makefile 中执行该脚本。这是行不通的，我假设出于类似的原因，即我正在从 shell 中运行 source。

我应该补充一点，如果我从终端运行 source activate myproject，它会正常工作。

Answer 1

我遇到了类似的问题；我想从 Makefile 创建或更新一个 conda 环境，以确保我自己的脚本可以使用该 conda 环境中的 python。
默认情况下，make 使用 sh 来执行命令，而 sh 不知道 source(另见 this SO answer)。我只是将 SHELL 设置为 bash 并以(仅相关部分)结束:

SHELL=/bin/bash
CONDAROOT = /my/path/to/miniconda2
.
.
install: sometarget
        source $(CONDAROOT)/bin/activate && conda env create -p conda -f environment.yml && source deactivate

希望对你有帮助