python - Cython 尝试编译两次，但失败了

Question

我有一个 setup.py 文件，与这里显示的非常相似:https://stackoverflow.com/a/49866324/4080129 .它看起来像这样:

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize
import numpy

sources = ["hs/subfolder/detect.pyx",
           "hs/subfolder/Donline.cpp",
           "hs/subfolder/Handler.cpp",
           "hs/subfolder/Process.cpp",
           "hs/subfolder/Filter.cpp",
           "hs/subfolder/Localize.cpp"]

exts = [Extension(name='hs.detect',
                  sources=sources,
                  extra_compile_args=['-std=c++11', '-O3'],
                  include_dirs=[numpy.get_include()])]

setup(
    ext_modules=cythonize(exts),
    include_dirs=[numpy.get_include()]
)

有一个包含一些纯 Python 的包，以及一个包含 Cython 文件的子模块。 setup.py 在父文件夹中，而不是在 Cython 文件夹中:

setup.py
hs/
    some_python.py
    subfolder/
        detect.pyx
        Donline.cpp
        ...etc

现在，setup.py 正确编译了所有文件 module/submodule/file1.cpp 等并将构建保存到 build/temp.linux-x86_64-3.6/module/submodule/文件1.o 。然而，就在那之后，它试图编译一个名为 file1.cpp 的文件，该文件不存在(正确的是 module/submodule/file1.cpp，并且已经编译好了)。

gcc -pthread -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -Ihs/subfolder -I/[...]/python3.6/site-packages/numpy/core/include -I/[...]/python3.6/site-packages/numpy/core/include -I/[...]/include -I/disk/scratch/miniconda/envs/my_default/include/python3.6m -c Donline.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.6/Donline.o -std=c++11 -O3
gcc: error: Donline.cpp: No such file or directory
gcc: fatal error: no input files
compilation terminated.
error: command 'gcc' failed with exit status 4

我很困惑，这完全阻止了我的代码编译...

Answer 1

原来.pyx文件包含一行

# distutils: sources = Donline.cpp Handler.cpp Process.cpp Filter.cpp Localize.cpp

它告诉 distutils 要编译什么。我没有意识到它，因为它看起来非常像一条注释掉的行，所以我没有意识到它在那里。

Cython 尝试编译也这些，而不是 setup.py 文件中包含的那些，即两个源列表都没有覆盖另一个。显然，尽管这些源在子文件夹中的 pyx 文件中列出，但预计它们位于相对于 setup.py 文件所在的文件的路径中，或者可能相对于文件夹我正在调用 python。

无论如何，删除该行解决了问题。