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python - GaussianHMM 中的解码序列

转载 作者:太空狗 更新时间:2023-10-29 16:58:14 24 4
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我正在使用隐马尔可夫模型来解决股票市场预测问题。我的数据矩阵包含针对特定安全性的各种功能:

01-01-2001, .025, .012, .01
01-02-2001, -.005, -.023, .02

我拟合了一个简单的 GaussianHMM:

from hmmlearn import GaussianHMM
mdl = GaussianHMM(n_components=3,covariance_type='diag',n_iter=1000)
mdl.fit(train[:,1:])

利用模型 (λ),我可以对观察向量进行解码,以找到最有可能对应观察向量的隐藏状态序列:

print mdl.decode(test[0:5,1:])
(72.75, array([2, 1, 2, 0, 0]))

上面,我已经解码了观察向量 Ot = (O1, O2, .. ., Od) 其中包含测试集中的前五个实例。我想估计测试集中第六个实例的隐藏状态。这个想法是为第六个实例迭代一组离散的可能特征值,并选择具有最高似然度的观察序列 Ot+1 argmax = P(O1 , O2, ..., Od+1 | λ ).一旦我们观察到 Od+1 的真实特征值,我们就可以将序列(长度为 5)移动一个并重新做一遍:

    l = 5
for i in xrange(len(test)-l):
values = []
for a in arange(-0.05,0.05,.01):
for b in arange(-0.05,0.05,.01):
for c in arange(-0.05,0.05,.01):
values.append(mdl.decode(vstack((test[i:i+l,1:],array([a,b,c])))))
print max(enumerate(values),key=lambda x: x[1])

问题是,当我对观察向量 Ot+1 进行解码时,具有最高可能性的预测几乎总是相同的(例如,具有最高可能性的估计总是具有 O< sub>d+1 等于 [ 0.04 0.04 0.04] 并且是隐藏状态 [0]):

(555, (74.71248518927949, array([2, 1, 2, 0, 0, 0]))) [ 0.04  0.04  0.04]
(555, (69.41963358191555, array([2, 2, 0, 0, 0, 0]))) [ 0.04 0.04 0.04]
(555, (77.11516871816922, array([2, 0, 0, 0, 0, 0]))) [ 0.04 0.04 0.04]

我完全有可能误解了 mdl.decode 的用途,从而错误地使用了它。如果是这样的话,我怎样才能最好地迭代 Od+1 的可能值,然后最大化 P(O1, O2, ..., Od+1 | λ)?

最佳答案

您的实际值是否有界 [-0.05, 0.05)

当我最初构建样本数据集来查看您的问题时,我在 [0,1] 中绘制了随机 float 。当我这样做时,我也得到了与您观察到的相同的结果 - 对于第六个条目,对于每个序列,始终是 (a,b,c) 的最大值,并且始终是相同的预测类.但是考虑到我的数据分布(均匀分布在 01 之间)比第六个条目的网格搜索值(在 - .05.05),HMM 总是选择最高值的三元组 (.04,.04,.04) 是有道理的,因为这最接近它所训练的分布的主要密度。

当我使用与我们允许的第六个条目 ([-0.05,0.05)) 相同的可能值范围内的均匀分布来重建数据集时,输出更加多样化:O_t+1 选择和类别预测都显示了跨序列的合理差异。从您的示例数据来看,您似乎确实至少有正值和负值,但您可以尝试绘制每个特征的分布,看看您的可能的第六项值范围是否都是合理的。

这是一些示例数据和评估代码。每当出现新的最佳 (a,b,c) 序列时,或者当第 6 次观察的预测发生变化时(只是为了表明它们并不完全相同),它都会打印一条消息.每个 6 元素序列的最高可能性以及预测和最佳第 6 个数据点存储在 best_per_span 中。

首先,构造一个样本数据集:

import numpy as np
import pandas as pd

dates = pd.date_range(start="01-01-2001", end="31-12-2001", freq='D')
n_obs = len(dates)
n_feat = 3
values = np.random.uniform(-.05, .05, size=n_obs*n_feat).reshape((n_obs,n_feat))
df = pd.DataFrame(values, index=dates)

df.head()
0 1 2
2001-01-01 0.020891 -0.048750 -0.027131
2001-01-02 0.013571 -0.011283 0.041322
2001-01-03 -0.008102 0.034088 -0.029202
2001-01-04 -0.019666 -0.005705 -0.003531
2001-01-05 -0.000238 -0.039251 0.029307

现在分为训练集和测试集:

train_pct = 0.7
train_size = round(train_pct*n_obs)
train_ix = np.random.choice(range(n_obs), size=train_size, replace=False)
train_dates = df.index[train_ix]

train = df.loc[train_dates]
test = df.loc[~df.index.isin(train_dates)]

train.shape # (255, 3)
test.shape # (110, 3)

在训练数据上拟合三态 HMM:

# hmm throws a lot of deprecation warnings, we'll suppress them.
import warnings
with warnings.catch_warnings():
warnings.filterwarnings("ignore",category=DeprecationWarning)
# in the most recent hmmlearn we can't import GaussianHMM directly anymore.
from hmmlearn import hmm

mdl = hmm.GaussianHMM(n_components=3, covariance_type='diag', n_iter=1000)
mdl.fit(train)

现在网格搜索最佳第 6 (t+1) 观察:

# length of O_t
span = 5

# final store of optimal configurations per O_t+1 sequence
best_per_span = []

# update these to demonstrate heterogenous outcomes
current_abc = None
current_pred = None

for start in range(len(test)-span):
flag = False
end = start + span
first_five = test.iloc[start:end].values
output = []
for a in np.arange(-0.05,0.05,.01):
for b in np.arange(-0.05,0.05,.01):
for c in np.arange(-0.05,0.05,.01):
sixth = np.array([a, b, c])[:, np.newaxis].T
all_six = np.append(first_five, sixth, axis=0)
output.append((mdl.decode(all_six), (a,b,c)))

best = max(output, key=lambda x: x[0][0])

best_dict = {"start":start,
"end":end,
"sixth":best[1],
"preds":best[0][1],
"lik":best[0][0]}
best_per_span.append(best_dict)

# below here is all reporting
if best_dict["sixth"] != current_abc:
current_abc = best_dict["sixth"]
flag = True
print("New abc for range {}:{} = {}".format(start, end, current_abc))

if best_dict["preds"][-1] != current_pred:
current_pred = best_dict["preds"][-1]
flag = True
print("New pred for 6th position: {}".format(current_pred))

if flag:
print("Test sequence StartIx: {}, EndIx: {}".format(start, end))
print("Best 6th value: {}".format(best_dict["sixth"]))
print("Predicted hidden state sequence: {}".format(best_dict["preds"]))
print("Likelihood: {}\n".format(best_dict["nLL"]))

循环运行时的报告输出示例:

New abc for range 3:8 = [-0.01, 0.01, 0.0]
New pred for 6th position: 1
Test sequence StartIx: 3, EndIx: 8
Best 6th value: [-0.01, 0.01, 0.0]
Predicted hidden state sequence: [0 2 2 1 0 1]
Likelihood: 35.30144407374163

New abc for range 18:23 = [-0.01, -0.01, -0.01]
New pred for 6th position: 2
Test sequence StartIx: 18, EndIx: 23
Best 6th value: [-0.01, -0.01, -0.01]
Predicted hidden state sequence: [0 0 0 1 2 2]
Likelihood: 34.31813078939214

best_per_span 的示例输出:

[{'end': 5,
'lik': 33.791537281734904,
'preds': array([0, 2, 0, 1, 2, 2]),
'sixth': [-0.01, -0.01, -0.01],
'start': 0},
{'end': 6,
'lik': 33.28967307589143,
'preds': array([0, 0, 1, 2, 2, 2]),
'sixth': [-0.01, -0.01, -0.01],
'start': 1},
{'end': 7,
'lik': 34.446813870838156,
'preds': array([0, 1, 2, 2, 2, 2]),
'sixth': [-0.01, -0.01, -0.01],
'start': 2}]

除了报告元素之外,这并不是对您最初方法的重大更改,但它似乎确实按预期工作,而且每次都没有达到极限。

关于python - GaussianHMM 中的解码序列,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/45538826/

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