python - f2py:公开 "used"模块的参数

Question

我认为这个问题已经在某个地方得到解决，但我花了过多的时间寻找答案，包括深入研究源代码。我试图将问题放在第一段中。其余部分显示了问题的基本示例。

我正在尝试编译一个包含 USE 语句的模块，该语句指向另一个更通用的模块。我宁愿将使用过的模块分开，以便它可以作为一组常规设置用于多个“包”中。当我使用 f2py 编译这两个模块时，一切都像 fortran 端所宣传的那样工作，但从 python 端 USE 似乎被忽略了。如果我允许 f2py 生成签名文件，该文件包含适当的 USE 语句，但如果我完成编译并从生成的库中导入，所用模块的参数在包含 use 语句的模块。以下是说明情况的两个模块:

MODULE test
    INTEGER, PARAMETER :: a = 1
END MODULE test

MODULE test2
    USE test
    INTEGER, PARAMETER :: b = 2
END MODULE test2

为了显示中间步骤，我运行了 f2py -h test.pyf test.f90 test2.f90。生成如下签名文件；请注意，“test2”模块包含“使用测试”:

!    -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.

python module test ! in
    interface  ! in :test
        module test ! in :test:test.f90
            integer, parameter,optional :: a=1
        end module test
        module test2 ! in :test:test2.f90
            use test
            integer, parameter,optional :: b=2
        end module test2
    end interface
end python module test

! This file was auto-generated with f2py (version:2).
! See http://cens.ioc.ee/projects/f2py2e/

如果我现在使用 f2py --fcompiler=gfortran -c test.pyf test.f90 test2.f90 进行编译，我将获得 test.so(与运行 f2py --fcompiler=gfortran 相同-m test -c test.f90 test2.f90 无需先创建签名文件)。在 python 中从该库导入会公开 test.test.a 和 test.test2.b，但不会公开 test.test2.a，如下所示:

In [1]: import test

In [2]: print test.test.a
1

In [3]: print test.test2.b
2

In [4]: print test.test2.a
---------------------------------------------------------------------------
AttributeError                            Traceback (most recent call last)
/users/solbrig/svn_checkouts/inversion/satmet/branches/solbrig/rootpath/data/users
/GeoIPS/src/test/<ipython-input-4-bffcf464e408> in <module>() 
----> 1 print test.test2.a

AttributeError: a

只是为了说明 b 从 fortran 的角度在 test2 中正确定义，下面的代码使用 test2 并打印 b 和 b:

SUBROUTINE run_test()
    USE test2
    IMPLICIT NONE
    print *, "a = ", a
    print *, "b = ", b
END SUBROUTINE run_test

用“f2py -m run_test -c test.f90 test2.f90 run_test.f90”编译并得到run_test.so后，run_test可以在python中导入并按预期运行:

In [1]: import run_test

In [2]: run_test.run_test()
 a =            1
 b =            2

如果您能就此问题提供任何帮助，我们将不胜感激。

TL;DR :当包含 USE 的 F90 模块由 f2py 编译时，它不会将“已使用”模块中定义的参数公开为属性在 Python 中。

Answer 1

我已经找到了这个问题的临时解决方案，但它不是最优的。我将继续研究 f2py 源代码，以便更好地理解它并修复代码本身的问题。在那之前，这是我的解决方案，其灵感来自 chatcannon's comment to the issue I posted to nympy's github .

有几种方法可以从临时角度解决这个问题，包括两种修改 .pyf 文件的方法。我不想修改 .pyf 文件，因为它作为较大包的一部分变得非常麻烦。为避免这种情况，我将 f2py 指令添加到我的 f90 源代码中。

以我原来的问题为例:

MODULE test
    INTEGER, PARAMETER :: a = 1
END MODULE test

MODULE test2
    USE test
    INTEGER, PARAMETER :: b = 2
END MODULE test2

只需在 test2 中添加一个 f2py 指令来向 f2py 展示如何定义 test2.a:

MODULE test
    INTEGER, PARAMETER :: a = 1
END MODULE test

MODULE test2
    USE test
    !f2py integer, parameter :: a  ! THIS EXPOSES `a` in `test2`
    INTEGER, PARAMETER :: b = 2
END MODULE test2

从生成的 test.so 导入正确地暴露了 test2.a:

In [1]: import test

In [2]: print test.test.a
1

In [3]: print test.test.b
---------------------------------------------------------------------------
AttributeError                            Traceback (most recent call last)
.../test_solution/<ipython-input-3-798b14f59815> in <module>()
----> 1 print test.test.b

AttributeError: b

In [4]: print test.test2.a
1

In [5]: print test.test2.b
2