python - 在 Bokeh (0.11) 服务器应用程序中刷新/更新绘图的快速正确方法是什么？

Question

我有一个 Bokeh (v0.11) 服务应用程序，它使用来自数据框的 (x,y) 坐标生成散点图。我想添加交互，以便当用户选择图上的点或在文本框中输入以逗号分隔的点的名称(即“p55，p1234”)时，这些点将在散点图上变为红色。

我找到了一种方法来实现这一点(下面的策略 #3)，但对于大型数据帧来说它非常慢。我认为有更好的方法。谁能帮我吗？我是否遗漏了一些明显的函数调用？

• 策略 1(100 个点 <1ms)钻取现有图的 ColumnDataSource 数据并尝试更改所选点。
• 策略 2(每 100 点约 70 毫秒)用新创建的 ColumnDataSource 覆盖绘图的现有 ColumnDataSource。
• 策略 3(每 100 点约 400 毫秒)是策略 2，然后重新创建这个数字。

代码存放在 pastebin 中:http://pastebin.com/JvQ1UpzY最相关的部分复制如下。

def refresh_graph(self, selected_points=None, old_idxs=None, new_idxs=None):
    # Strategy 1: Cherry pick current plot's source.
    # Compute time for 100 points: < 1ms.
    if self.strategy == 1:
        t1 = datetime.now()
        for idx in old_idxs:
            self.graph_plot.data_source.data['color'][idx] = 'steelblue'
        for idx in new_idxs:
            self.graph_plot.data_source.data['color'][idx] = 'red'
        print('Strategy #1 completed in {}'.format(datetime.now() - t1))
    else:
        t3 = datetime.now()
        self.coords['color'] = 'steelblue'
        self.coords.loc[selected_points, 'color'] = 'red'
        new_source = bkmodels.ColumnDataSource(self.coords)
        self.graph_plot = self.graph_fig.scatter('x', 'y', source=new_source, color='color', alpha=0.6)
        print('Strategy #3 completed in {}'.format(datetime.now() - t3))
    return

理想情况下，我希望能够使用策略 #1，但它似乎不允许点在客户端浏览器中刷新。

感谢您的帮助!

仅供引用:我正在使用 RHEL 6.X

Answer 1

如果您正在流 数据，那么这里有一个相关的答案:Timeseries streaming in bokeh

如果您需要一次更新所有内容，那么您可以这样做，我的建议是您的策略 1，它已被证明，例如这里:

https://github.com/bokeh/bokeh/blob/master/examples/app/sliders.py

需要特别注意的是，您确实必须一次性更新所有 source.data。其中一个假设是列数据源的所有列始终具有相同的长度。更新单个列存在打破此假设的风险，这可能会导致问题。所以您想一次更新所有内容，例如:

# Generate the new curve
x = np.linspace(0, 4*np.pi, N)
y = a*np.sin(k*x + w) + b

source.data = dict(x=x, y=y)