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假设一个通用的滑动算法在内核上执行一些函数,例如图像处理中的均值滤波器(average-filter)或绝对差求和算法。当内核滑动到下一个位置时,将会有一些内存的冗余读取,因为新内核所包含的数据会与之前的数据有所重叠。
让我用一个实际的例子来解释......假设你想对一个内核(窗口)大小为 3x3 的大型二维矩阵执行中值滤波。内核的第一个位置(下图中的红色)将以 (1,1) 为中心,第二个位置(绿色)将以 (1,2) 为中心。请注意黄色区域是如何重叠的,现在需要从内存中重新加载这些值。
我的具体问题是 3D 均值滤波器,因此重叠更大(3D 为 3^3-3^2 = 18,2D 为 3^2-3 = 6)。
我确定这是一个常见问题...有谁知道如何有效地实现此类算法以消除冗余内存查找,或利用现代架构(例如, 2 路关联缓存)?
我在 3D 中的特定问题仅采用最近的 6 个邻居(不是对角线邻居)的平均值,并在 C 中实现如下:
for( i = 0; i <= maxi; i++ ) {
for( j = 0; j <= maxj; j++ ) {
for( k = 0; k <= maxk; k++ ) {
filteredData[ i ][ j ][ k ] =
ONE_SIXTH *
(
data[ i + 1 ][ j ][ k ] +
data[ i - 1 ][ j ][ k ] +
data[ i ][ j + 1 ][ k ] +
data[ i ][ j - 1 ][ k ] +
data[ i ][ j ][ k + 1 ] +
data[ i ][ j ][ k - 1 ]
);
}
}
}
最佳答案
您所做的称为<strong>卷积。您将多维数据与维数相同的较小内核进行卷积。这是一项非常常见的任务,并且有大量的库可用于此任务。
快速解决方案 ( depending on the kernel size ) 是计算频域中的卷积。您计算数据和内核的(多维)FFT,将它们相乘,然后计算逆 FFT。您会发现经过优化的库可以做到这一点,例如。对于 Python 有 scipy.ndimage.filters.convolve和 scipy.signal.fftconvolve .
平铺 是一种常用的图像处理技术,用于优化低级内存访问。您分配适合 CPU 缓存的正方形图 block (或立方体)。当您访问相邻像素时,它们大多数时候会在内存中靠近在一起。不过,遍历整个数组有点棘手。
为了进一步阅读,我推荐论文 Why Modern CPUs Are Starving and What Can Be Done about It ,其中提到了这种内存阻塞技术,并指向实现它的数字库。
最后是 Integral Image,它允许您 calculate the average任意矩形/长方体的内存访问次数非常少。
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