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近一个月来,我一直在与一个非常奇怪的错误作斗争。问你们是我最后的希望。我用 C 编写了一个程序,它集成了 2d Cahn–Hilliard equation在傅里叶(或倒数)空间中使用隐式欧拉 (IE) 方案:
其中“帽子”表示我们在傅里叶空间中:h_q(t_n+1) 和 h_q(t_n) 是 h(x,y) 在时间 t_n 和 t_(n+1) 的 FT,N[ h_q] 是在傅立叶空间中应用于 h_q 的非线性算子,而 L_q 是线性算子,同样在傅立叶空间中。我不想过多地介绍我正在使用的数值方法的细节,因为我确信问题不在于此(我尝试使用其他方案)。
我的代码其实很简单。这是开始,我基本上在这里声明变量、分配内存并为 FFTW 例程创建计划。
# include <stdlib.h>
# include <stdio.h>
# include <time.h>
# include <math.h>
# include <fftw3.h>
# define pi M_PI
int main(){
// define lattice size and spacing
int Nx = 150; // n of points on x
int Ny = 150; // n of points on y
double dx = 0.5; // bin size on x and y
// define simulation time and time step
long int Nt = 1000; // n of time steps
double dt = 0.5; // time step size
// number of frames to plot (at denominator)
long int nframes = Nt/100;
// define the noise
double rn, drift = 0.05; // punctual drift of h(x)
srand(666); // seed the RNG
// other variables
int i, j, nt; // variables for space and time loops
// declare FFTW3 routine
fftw_plan FT_h_hft; // routine to perform fourier transform
fftw_plan FT_Nonl_Nonlft;
fftw_plan IFT_hft_h; // routine to perform inverse fourier transform
// declare and allocate memory for real variables
double *Linft = fftw_alloc_real(Nx*Ny);
double *Q2 = fftw_alloc_real(Nx*Ny);
double *qx = fftw_alloc_real(Nx);
double *qy = fftw_alloc_real(Ny);
// declare and allocate memory for complex variables
fftw_complex *dh = fftw_alloc_complex(Nx*Ny);
fftw_complex *dhft = fftw_alloc_complex(Nx*Ny);
fftw_complex *Nonl = fftw_alloc_complex(Nx*Ny);
fftw_complex *Nonlft = fftw_alloc_complex(Nx*Ny);
// create the FFTW plans
FT_h_hft = fftw_plan_dft_2d ( Nx, Ny, dh, dhft, FFTW_FORWARD, FFTW_ESTIMATE );
FT_Nonl_Nonlft = fftw_plan_dft_2d ( Nx, Ny, Nonl, Nonlft, FFTW_FORWARD, FFTW_ESTIMATE );
IFT_hft_h = fftw_plan_dft_2d ( Nx, Ny, dhft, dh, FFTW_BACKWARD, FFTW_ESTIMATE );
// open file to store the data
char acstr[160];
FILE *fp;
sprintf(acstr, "CH2d_IE_dt%.2f_dx%.3f_Nt%ld_Nx%d_Ny%d_#f%.ld.dat",dt,dx,Nt,Nx,Ny,Nt/nframes);
在此序言之后,我用均匀的随机噪声初始化我的函数 h(x,y),并且我还对其进行了 FT。我将 h(x,y) 的虚部,也就是代码中的 dh[i*Ny+j][1]
设置为 0,因为它是一个实函数。然后我计算波 vector qx
和 qy
,并用它们计算我的方程在傅立叶空间中的线性算子,即 Linft
代码。我只考虑 h 的 - 四阶导数作为线性项,因此线性项的 FT 只是 -q^4... 但是,我不想详细介绍我的积分方法。问题不在于此。
// generate h(x,y) at initial time
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
rn = (double) rand()/RAND_MAX; // extract a random number between 0 and 1
dh[i*Ny+j][0] = drift-2.0*drift*rn; // shift of +-drift
dh[i*Ny+j][1] = 0.0;
}
}
// execute plan for the first time
fftw_execute (FT_h_hft);
// calculate wavenumbers
for (i = 0; i < Nx; i++) { qx[i] = 2.0*i*pi/(Nx*dx); }
for (i = 0; i < Ny; i++) { qy[i] = 2.0*i*pi/(Ny*dx); }
for (i = 1; i < Nx/2; i++) { qx[Nx-i] = -qx[i]; }
for (i = 1; i < Ny/2; i++) { qy[Ny-i] = -qy[i]; }
// calculate the FT of the linear operator
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
Q2[i*Ny+j] = qx[i]*qx[i] + qy[j]*qy[j];
Linft[i*Ny+j] = -Q2[i*Ny+j]*Q2[i*Ny+j];
}
}
然后,终于到了时间循环。本质上,我所做的是:
每隔一段时间,我将数据保存到文件中并在终端上打印一些信息。特别是,我打印了非线性项的 FT 的最高值。我还检查 h(x,y) 是否发散到无穷大(这不应该发生!),
在直接空间中计算 h^3(即 dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+ j][0]
).同样,虚部设置为0,
取h^3的FT,
通过计算-q^2*(FT[h^3] - FT[h])得到倒数空间中完整的非线性项(即上面写的IE算法中的N[h_q])。在代码中,我指的是 Nonlft[i*Ny+j][0] = -Q2[i*Ny+j]*(Nonlft[i*Ny+j][0] -dhft[ i*Ny+j][0])
和下面的虚部。我这样做是因为:
代码如下:
for(nt = 0; nt < Nt; nt++) {
if((nt % nframes)== 0) {
printf("%.0f %%\n",((double)nt/(double)Nt)*100);
printf("Nonlft %.15f \n",Nonlft[(Nx/2)*(Ny/2)][0]);
// write data to file
fp = fopen(acstr,"a");
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
fprintf(fp, "%4d %4d %.6f\n", i, j, dh[i*Ny+j][0]);
}
}
fclose(fp);
}
// check if h is going to infinity
if (isnan(dh[1][0])!=0) {
printf("crashed!\n");
return 0;
}
// calculate nonlinear term h^3 in direct space
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
Nonl[i*Ny+j][0] = dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0];
Nonl[i*Ny+j][1] = 0.0;
}
}
// Fourier transform of nonlinear term
fftw_execute (FT_Nonl_Nonlft);
// second derivative in Fourier space is just multiplication by -q^2
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
Nonlft[i*Ny+j][0] = -Q2[i*Ny+j]*(Nonlft[i*Ny+j][0] -dhft[i*Ny+j][0]);
Nonlft[i*Ny+j][1] = -Q2[i*Ny+j]*(Nonlft[i*Ny+j][1] -dhft[i*Ny+j][1]);
}
}
// Implicit Euler scheme in Fourier space
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
dhft[i*Ny+j][0] = (dhft[i*Ny+j][0] + dt*Nonlft[i*Ny+j][0])/(1.0 - dt*Linft[i*Ny+j]);
dhft[i*Ny+j][1] = (dhft[i*Ny+j][1] + dt*Nonlft[i*Ny+j][1])/(1.0 - dt*Linft[i*Ny+j]);
}
}
// transform h back in direct space
fftw_execute (IFT_hft_h);
// normalize
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
dh[i*Ny+j][0] = dh[i*Ny+j][0] / (double) (Nx*Ny);
dh[i*Ny+j][1] = dh[i*Ny+j][1] / (double) (Nx*Ny);
}
}
}
代码的最后一部分:清空内存并销毁FFTW计划。
// terminate the FFTW3 plan and free memory
fftw_destroy_plan (FT_h_hft);
fftw_destroy_plan (FT_Nonl_Nonlft);
fftw_destroy_plan (IFT_hft_h);
fftw_cleanup();
fftw_free(dh);
fftw_free(Nonl);
fftw_free(qx);
fftw_free(qy);
fftw_free(Q2);
fftw_free(Linft);
fftw_free(dhft);
fftw_free(Nonlft);
return 0;
}
如果我运行此代码,我将获得以下输出:
0 %
Nonlft 0.0000000000000000000
1 %
Nonlft -0.0000000000001353512
2 %
Nonlft -0.0000000000000115539
3 %
Nonlft 0.0000000001376379599
...
69 %
Nonlft -12.1987455309071730625
70 %
Nonlft -70.1631962517720353389
71 %
Nonlft -252.4941743351609204637
72 %
Nonlft 347.5067875825179726235
73 %
Nonlft 109.3351142318568633982
74 %
Nonlft 39933.1054502610786585137
crashed!
代码在到达终点之前崩溃,我们可以看到非线性项发散。
现在,对我来说没有意义的是,如果我按以下方式更改计算非线性项 FT 的行:
// calculate nonlinear term h^3 -h in direct space
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
Nonl[i*Ny+j][0] = dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0] -dh[i*Ny+j][0];
Nonl[i*Ny+j][1] = 0.0;
}
}
// Fourier transform of nonlinear term
fftw_execute (FT_Nonl_Nonlft);
// second derivative in Fourier space is just multiplication by -q^2
for ( i = 0; i < Nx; i++ ) {
for ( j = 0; j < Ny; j++ ) {
Nonlft[i*Ny+j][0] = -Q2[i*Ny+j]* Nonlft[i*Ny+j][0];
Nonlft[i*Ny+j][1] = -Q2[i*Ny+j]* Nonlft[i*Ny+j][1];
}
}
这意味着我正在使用这个定义:
而不是这个:
那么代码就完全稳定了,没有发散发生!即使是数十亿个时间步! 为什么会发生这种情况,因为计算 Nonlft
的两种方法应该是等价的?
非常感谢任何愿意花时间阅读所有这些内容并给我一些帮助的人!
编辑:为了让事情变得更奇怪,我应该指出这个错误不会发生在一维的同一系统上。在 1D 中,两种计算 Nonlft
的方法都是稳定的。
编辑:我添加了一个简短的动画,说明函数 h(x,y) 在崩溃之前发生了什么。另外:我很快在 MATLAB 中重新编写了代码,它使用基于 FFTW 库的快速傅立叶变换函数,但错误并没有发生……谜团加深了。
最佳答案
我解决了!!问题是 Nonl
项的计算:
Nonl[i*Ny+j][0] = dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0];
Nonl[i*Ny+j][1] = 0.0;
需要修改为:
Nonl[i*Ny+j][0] = dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0] -3.0*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][1]*dh[i*Ny+j][1];
Nonl[i*Ny+j][1] = -dh[i*Ny+j][1]*dh[i*Ny+j][1]*dh[i*Ny+j][1] +3.0*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][0]*dh[i*Ny+j][1];
换句话说:我需要将 dh
视为一个复杂函数(即使它应该是真实的)。
基本上,由于愚蠢的舍入错误,实函数的 FT 的 IFT(在我的例子中是 dh
),不是纯粹的 strong>,但会有非常小的虚部。通过设置 Nonl[i*Ny+j][1] = 0.0
我完全忽略了这个虚部。那么,问题是我递归地对 FT(dh
)、dhft
和使用 IFT(FT(dh
)), 这是Nonlft
,但忽略剩余的虚部!
Nonlft[i*Ny+j][0] = -Q2[i*Ny+j]*(Nonlft[i*Ny+j][0] -dhft[i*Ny+j][0]);
Nonlft[i*Ny+j][1] = -Q2[i*Ny+j]*(Nonlft[i*Ny+j][1] -dhft[i*Ny+j][1]);
显然,将Nonlft
计算为dh
^3 -dh
,然后做
Nonlft[i*Ny+j][0] = -Q2[i*Ny+j]* Nonlft[i*Ny+j][0];
Nonlft[i*Ny+j][1] = -Q2[i*Ny+j]* Nonlft[i*Ny+j][1];
避免了进行这种“混合”求和的问题。
呼...真让人松了一口气!我希望我能把赏金分配给自己! :P
编辑:我想补充一点,在使用 fftw_plan_dft_2d
函数之前,我使用的是 fftw_plan_dft_r2c_2d
和 fftw_plan_dft_c2r_2d
(实到-复杂和复杂到真实),我看到了同样的错误。但是,我想如果我不切换到 fftw_plan_dft_2d
就无法解决它,因为 c2r
函数会自动“切断”来自旅游学院。 如果是这种情况并且我没有遗漏任何东西,我认为这应该写在 FFTW 网站的某个地方,以防止用户遇到这样的问题。 像“r2c
和 c2r
变换不利于实现伪谱方法。
编辑:我找到了 another SO question这解决了完全相同的问题。
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