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我正在开发一个小型应用程序，并考虑将 BLAST 或其他本地比对搜索集成到我的应用程序中。我的搜索只调出程序，需要作为外部程序安装和调用。
从头开始实现它还有什么办法吗？可能有任何预制库吗？
最佳答案
是否必须使用 C，或者 C++ 也可以？如果是这样，您可能需要查看 SeqAn 库 here .
关于c - 直接从我的应用程序执行 BLAST/Smith Waterman 搜索，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/1432467/
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如何修改 Smith-Waterman algorithm在 Perl 中使用替换矩阵比对蛋白质？ [需要引用] 最佳答案 我实际上是一名生物信息学研究人员，并且正在等待他自己的生物信息学代码运行，所
我编写了一些实现 Smith-Waterman 算法的 Java 代码。我有一个日记条目 here是这样说的 sim (X, Y) = 2 . SLength (X, Y) / Length
我是一名优秀的程序员,十分优秀！