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我正忙于编写一个可以从 FTP 下载一些文件的脚本,我想要一个选择语句来提供 ftp 子目录中的目录。但也给一个选项下载所有这一切都应该发生@ $DNAtype 在底部。有人有什么想法吗?
我的代码是:(抱歉荷兰语评论)
#!/bin/bash/
#16-03-2012
#Sander van der Zeeuw s1040176
#Variabele om de ftp aan te kunnen roepen
var='ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-66/fasta/'
#Hier word de lijst met beschikbare organisme binnengehaald via de functie curl.
# curl is te installeren via de terminal met het command sudo apt-get install curl
lijst=`curl $var | awk '{print $NF}'`
echo "de keuze 0 selecteert alles"
#hier wordt een directory aangemaakt om de files in weg te schrijven
mkdir -p dnaenpep
cd dnaenpep
#Hier wordt een keuze menu gecreeerd om het juiste organisme te kiezen.
select specie in $lijst
do
break
done
echo "Uw keuze is:" $specie
#Hier wordt de keuze "0" ingebouwd. Zodat alle genomen gedownload worden.
if [ "$specie" == "" ]
then
for i in $lijst
do
namen=$(curl $var$i/dna/ | awk '{print($NF)}')
for files in $namen; do curl $var$i/dna/$files -o $files
curl $var$i/pep/$files -o $files
done
done
fi
echo "de keuze 0 selecteert alles"
#Wanneer de loop niet uitgevoerd wordt, zal via nog een select statement de gekozen worden #welk DNA je van de ftp wil downloaden.
lijst2=`curl $var$specie/ | awk '{print $9}'`
echo $lijst2
select dnatype in $lijst2
do
break
done
echo "uw keuze is:" $dnatype
if [$dnatype == ""]
then
for i in $dnatype
do
wget -O DNAtype "$var$specie/dna/"
wget -O DNAtype "$var$specie/pep/"
done
fi
#Hier worden de files die in $dnatype gemaakt worden gedownload.
wget -O DNAtype "$var$specie/$dnatype/"
cat DNAtype | egrep "=" | tr '"' '\n' | sort | grep ^"ftp" |grep gz > Downlist.txt
wget -c -i Downlist.txt
exit
最佳答案
您的 select 语句应该使用一个数组,您可以向该数组添加其他项,或者在 select
语句中的数组名称之后添加它们。
lijst2=($(curl "$var$specie/" | awk '{print $9}')
lijst2+=("Another option" "Additional option" "Download all")
echo "${lijst2[@]}"
select dnatype in "${lijst2[@]}"
do
break
done
echo "uw keuze is: $dnatype"
或
lijst2=($(curl "$var$specie/" | awk '{print $9}')
echo "${lijst2[@]}"
select dnatype in "${lijst2[@]}" "Another option" "Additional option" "Download all"
do
break
done
echo "uw keuze is: $dnatype"
你选择哪个取决于你是否想要数组中添加的选项。
要全部下载,只需遍历数组(因此您可能希望使用第二个版本,这样您就不必跳过“全部下载”,例如,因为它不是文件名。
补充说明:
使用 $()
代替反引号进行命令替换。
此语句 if [$dnatype == ""]
需要空格:if [ $dnatype == ""]
。
展开时引用所有变量。你在一些地方这样做了,但在其他地方没有这样做。
接近尾声的长流水线几乎肯定可以简化。在没有看到示例数据的情况下,我只能猜测是如何做到的。
关于带有额外选项的 Linux select 语句,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/11281022/
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