linux - 如何在 `mpirun` 的命令行上指定节点？

Question

如何使用 mpirun 的 -machine 标志？

要选择要在哪个集群节点上执行，我想出了像这样使用 mpirun 的 -machinefile 选项

> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np <integer> <executable-filename>

Host_file 包含一个节点列表，每行一个。

但我想提交一大堆具有不同参数的进程，我不希望它们在同一个节点上运行。也就是说，我想做类似的事情

> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np 1 filename 1
nano Host_file % change the first node name
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np 1 filename 2
nano Host_file
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np 1 filename 3
nano Host_file
...

我可以使用 -machine 标志，然后为每次执行键入不同的节点。但我无法让它工作。例如

> mpirun -machine node21-ib -np 1 FPU
> mpirun -machine node21 -np 1 FPU

始终在主节点上执行。

我还尝试了 -nodes 选项

> mpirun -nodes node21-ib -np 1 FPU
> mpirun -nodes node21 -np 1 FPU

但这只是在我当前的节点上执行。

同样，我尝试了 -nolocal 和 -exclude 选项但没有成功。

所以我有一个简单的问题:如何使用 -machine 选项？或者是否有更好的方法(对于 Linux 新手)？

我正在使用以下版本的 MPI，它在网络上的文档似乎少得惊人(到目前为止，我所有的文档都来自 > mpirun --help)。

> mpichversion
MPICH Version:          1.2.7
MPICH Release date:     $Date: 2005/06/22 16:33:49$
MPICH Patches applied:  none
MPICH configure:        --with-device=ch_gen2 --with-arch=LINUX -prefix=/usr/local/mvapich-gcc --with-romio --without-mpe -lib=-L/usr/lib64 -Wl,-rpath=/usr/lib64 -libverbs -libumad -lpthread
MPICH Device:           ch_gen2

感谢您的帮助。

Answer 1

你需要的是指定一个hosts文件

例如，在您的 mpirun 命令中尝试 mpirun -np 4 -hostfile hosts ./exec

其中 hosts 通常包含您的 ip 地址 192.168.1.201:8 其中最后一位是最大核心数，用换行符分隔每个节点。理想情况下，您应该安装一些集群管理软件，例如 torque 和 maui。