r - "rgdal"在ubuntu上安装失败

Question

我使用 travis 检查我的 R 包，它基于 ubuntu 虚拟机。我的依赖项之一是来自 CRAN 的 rgdal，它无法在 travis 上正确安装。

首先它说:

ERROR: dependencies ‘rgdal’ is not available for package ‘my package’

我遵循了说明 here ，接着就是没完没了的依赖，我按照每次试用的说明，一个一个安装。最后我安装的包如下:

  libproj-dev
  libcurl4-gnutls-dev
  libdap-dev
  libgdal-dev
  libgdal1h
  libhdf5-dev
  libhdf5-serial-dev
  libgdal-dev
  libgdal1-dev

它说我还需要安装 libhdf5-7 = 1.8.11-3ubuntu1~precise1~ppa1

但是当我安装包 libhdf5-7 = 1.8.11-3ubuntu1~precise1~ppa1 时，它给出了另一个错误:

E: Unable to locate package 
E: Unable to locate package 1.8.11-3ubuntu1~precise1~ppa1
E: Couldn't find any package by regex '1.8.11-3ubuntu1~precise1~ppa1'

现在似乎没有更多的解决方案。

我想知道如何在 travis 上解决这个问题？这是仅在 travis 虚拟机上常见的问题还是可能在任何 ubuntu 机器上发生？或者包 rgdal 与 ubuntu 有一些问题？`

背景:

我上面的安装都是使用travis的apt-packages，travis解释如下:

apt_packages: A list of packages to install via apt-get. Common examples here include entries in SystemRequirements. This option is ignored on non-linux builds

Answer 1

从本周开始，您可以选择在 Travis 上使用 Ubuntu 14.04:

• 查看此 blog post from Travis for details
• 查看此 .travis.yml我在这里启用 Trusty aka 14.04

在这种情况下切换到 14.04 可能就足够了。如果没有，请注意您可以准备您自己的 .deb 包。我提到这个in an blog post从今年夏天开始。

由于地理空间包有点复杂，这可能是你最好的。您需要知道如何构建 Debian 软件包，以及如何使用 Launchpad 为您自动构建它们。这两个主题都有很多教程。