r - rgdal "gdal-config"配置错误

Question

我目前正在 Linux 集群上用 R 运行一些物种分布建模和丰富度映射。为了运行我的分析，我需要安装 rgdal 以便我的建模包中的栅格函数正常工作。我已经安装了 proj4 和 gdal。但是，当我尝试安装 rgdal 时，我收到一条错误消息:

checking for gdal-config... no
no

configure: error: gdal-config not found or not executable.
ERROR: configuration failed for package 'rgdal'

这是我用来安装 rgdal 包的命令:

install.packages("rgdal", configure.args=c("--with-proj-include=/home/nikhail1/bin/proj-4.9.2/bin", "--with-proj-lib=/home/nikhail1/bin/proj-4.9,2/lib"))

然而，尽管存在 gdal-config 错误，gdal 似乎已安装到我的本地系统上(二进制文件和库文件夹存在于我安装它们的地址中)。我在 gdal 安装过程中也没有看到任何错误消息。为什么会出现此错误？我如何让 R 识别已安装此依赖项，或者如果确实存在问题，我该如何识别它？我在网上找到的大多数解决方案都是针对我没有使用的 Debian 和 Ubuntu 系统的。我无权使用 sudo apt-get 或 yum 命令。由于我只安装了 proj 4.9.2，是否缺少任何 gdal 依赖项？

我是 linux 系统以及 rgdal 和 gdal 包的新手。

非常感谢您的帮助

亲切的问候，

尼凯尔

Answer 1

在 Linux 上的 R 中安装 RGDAL

在 R 中运行此命令:

# install package from CRAN
# but specify the library director
# the download method
# and the configuration arguments
# to allow for source installs
install.packages( pkgs = "rgdal"
                    , lib = "./R_Packages"
                    , method = "curl"
                    , configure.args = c(
                                   "--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config"
                                   , "--with-proj-include=/p/home/bin/proj4/include"
                                   , "--with-proj-lib=/p/home/bin/proj4/lib"
                                     ) 
      )

答案来自交叉引用Errors installing rgdal on LINUX system?和 Trouble installing rgdal .