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我正在 Python/NumPy 中实现贝叶斯变点检测(如果您有兴趣,请查看 paper)。我需要计算 [a, b]
范围内数据的可能性, 其中a
和 b
可以拥有来自 1
的所有值至 n
.然而,我可以在某些时候修剪计算,这样我就不必计算每一个可能性。另一方面,一些可能性被多次使用,因此我可以通过将值保存在矩阵 P[a, b]
中来节省时间。 .现在,每当我使用它时,我都会检查该值是否已经计算,但我发现这有点麻烦。它看起来像这样:
# ...
P = np.ones((n, n)) * np.inf # a likelihood can't get inf, so I use it
# as pseudo value
for a in range(n):
for b in range(a, n):
# The following two lines get annoying and error prone if you
# use P more than once
if P[a, b] == np.inf:
P[a, b] = likelihood(data, a, b)
Q[a] += P[a, b] * g[a] * Q[a - 1] # some computation using P[a, b]
# ...
我想知道,是否有更直观和 pythonic 的方式来实现这一目标,而无需 if ...
每次使用 P[a, b]
之前的声明.如果不满足某些条件,则类似于自动函数调用。我当然可以制作 likelihood
函数意识到它可以保存值,但是它需要某种状态(例如成为一个对象)。我想避免这种情况。
似然函数
由于在评论中被要求,我添加了似然函数。它实际上先计算共轭先验,然后计算似然。并且全部以日志表示...所以它非常复杂。
from scipy.special import gammaln
def gaussian_obs_log_likelihood(data, t, s):
n = s - t
mean = data[t:s].sum() / n
muT = (n * mean) / (1 + n)
nuT = 1 + n
alphaT = 1 + n / 2
betaT = 1 + 0.5 * ((data[t:s] - mean) ** 2).sum() + ((n)/(1 + n)) * (mean**2 / 2)
scale = (betaT*(nuT + 1))/(alphaT * nuT)
# splitting the PDF of the student distribution up is /much/ faster. (~ factor 20)
prob = 1
for yi in data[t:s]:
prob += np.log(1 + (yi - muT)**2/(nuT * scale))
lgA = gammaln((nuT + 1) / 2) - np.log(np.sqrt(np.pi * nuT * scale)) - gammaln(nuT/2)
return n * lgA - (nuT + 1)/2 * prob
虽然我使用的是 Python 2.7,但对 2.7 和 3.x 的回答都表示赞赏。
最佳答案
为此,我会使用 defaultdict
的同级(您不能直接使用 defaultdict
,因为它不会告诉您缺少的 key ):
class Cache(object):
def __init__(self):
self.cache = {}
def get(self, a, b):
key = (a,b)
result = self.cache.get(key, None)
if result is None:
result = likelihood(data, a, b)
self.cache[key] = result
return result
另一种方法是在可能性
上使用缓存装饰器 as described here .
关于python - 有条件计算的最pythonic方法是什么?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/22958243/
我想了解 Ruby 方法 methods() 是如何工作的。 我尝试使用“ruby 方法”在 Google 上搜索,但这不是我需要的。 我也看过 ruby-doc.org,但我没有找到这种方法。
Test 方法 对指定的字符串执行一个正则表达式搜索,并返回一个 Boolean 值指示是否找到匹配的模式。 object.Test(string) 参数 object 必选项。总是一个
Replace 方法 替换在正则表达式查找中找到的文本。 object.Replace(string1, string2) 参数 object 必选项。总是一个 RegExp 对象的名称。
Raise 方法 生成运行时错误 object.Raise(number, source, description, helpfile, helpcontext) 参数 object 应为
Execute 方法 对指定的字符串执行正则表达式搜索。 object.Execute(string) 参数 object 必选项。总是一个 RegExp 对象的名称。 string
Clear 方法 清除 Err 对象的所有属性设置。 object.Clear object 应为 Err 对象的名称。 说明 在错误处理后,使用 Clear 显式地清除 Err 对象。此
CopyFile 方法 将一个或多个文件从某位置复制到另一位置。 object.CopyFile source, destination[, overwrite] 参数 object 必选
Copy 方法 将指定的文件或文件夹从某位置复制到另一位置。 object.Copy destination[, overwrite] 参数 object 必选项。应为 File 或 F
Close 方法 关闭打开的 TextStream 文件。 object.Close object 应为 TextStream 对象的名称。 说明 下面例子举例说明如何使用 Close 方
BuildPath 方法 向现有路径后添加名称。 object.BuildPath(path, name) 参数 object 必选项。应为 FileSystemObject 对象的名称
GetFolder 方法 返回与指定的路径中某文件夹相应的 Folder 对象。 object.GetFolder(folderspec) 参数 object 必选项。应为 FileSy
GetFileName 方法 返回指定路径(不是指定驱动器路径部分)的最后一个文件或文件夹。 object.GetFileName(pathspec) 参数 object 必选项。应为
GetFile 方法 返回与指定路径中某文件相应的 File 对象。 object.GetFile(filespec) 参数 object 必选项。应为 FileSystemObject
GetExtensionName 方法 返回字符串,该字符串包含路径最后一个组成部分的扩展名。 object.GetExtensionName(path) 参数 object 必选项。应
GetDriveName 方法 返回包含指定路径中驱动器名的字符串。 object.GetDriveName(path) 参数 object 必选项。应为 FileSystemObjec
GetDrive 方法 返回与指定的路径中驱动器相对应的 Drive 对象。 object.GetDrive drivespec 参数 object 必选项。应为 FileSystemO
GetBaseName 方法 返回字符串,其中包含文件的基本名 (不带扩展名), 或者提供的路径说明中的文件夹。 object.GetBaseName(path) 参数 object 必
GetAbsolutePathName 方法 从提供的指定路径中返回完整且含义明确的路径。 object.GetAbsolutePathName(pathspec) 参数 object
FolderExists 方法 如果指定的文件夹存在,则返回 True;否则返回 False。 object.FolderExists(folderspec) 参数 object 必选项
FileExists 方法 如果指定的文件存在返回 True;否则返回 False。 object.FileExists(filespec) 参数 object 必选项。应为 FileS
我是一名优秀的程序员,十分优秀!