python - 使用 R Markdown 样式文档 (.Rmd) 作为 Pweave 的输入

Question

我正在尝试通过 Pweave 运行基本的 R Markdown 文档(在代码块中调用 python)。在Pweave documentation它声明您可以使用样式 ```{python} 声明代码块。但是，当我尝试使用例如 pweave -f pandoc FIR_design.mdw 进行编译时， block 不会运行，而是逐字放置。

所有 examples in the documentation使用 noweb 语法，例如

<<fig = True, width = '12 cm', echo = False>>=
from pylab import *
plot(arange(10))
show()
@

Markdown 相当于:

```{python, fig = True, width = '12 cm', echo = False}
from pylab import *
plot(arange(10))
show()
```

当我尝试使用 markdown 语法运行示例时，它只是逐字添加它们并且不运行 block 。这是预期的吗？如果是这样，我应该如何转换我的 .Rmd 文档，使它们可以在 Pweave 中运行。我必须将它们转换为 noweb 样式吗？

这是文档示例文档 FIR_design.mdw以 .Rmd 格式重写(例如):

• FIR_design.Rmd

Answer 1

而不是 pweave -f pandoc <source>尝试使用 pweave -i markdown <source> .

如果不提供输入格式，则为deduced from file extension .正如您在链接源中看到的那样，您的输入文件需要有 .md自动检测为“Pandoc markdown”格式的扩展名。

默认输出格式似乎与输入相同，或者与 --format (-f) 提供的一样.