python - 如何从具有列表值的字典中检索给定键序列的所有可能组合

Question

例如我有这本字典

d={'M':['ATG'],'D':['GAC','GAT'],'E':['GAA','GAG']}

在给定键序列的情况下，我希望得到的输出是一个包含所有可能序列的列表。 (也可以是一个字符串，其中所有可能的序列将在单独的行中“\n”)

sequence = "MDE" 

所以，输出应该是这样的:

['ATGGACGAA','ATGGACGAG','ATGGATGAA','ATGGATGAG']

目前我尝试过的是下面的，当然这不是我想要的:

seq_trans = ''

for aa in sequence:
  for k, v in d.iteritems():
    if k == aa:
      for item in v:
        seq_trans= seq_trans + item
print seq_trans

我得到的“MDE”是:

'ATGGACGATGAAGAG'

Answer 1

您可以使用 itertools.product在这里，它返回输入迭代的笛卡尔积。

In [78]: seq="MED"

In [79]: ["".join(x) for x in product(*(d[y] for y in seq))]
Out[79]: ['ATGGAAGAC', 'ATGGAAGAT', 'ATGGAGGAC', 'ATGGAGGAT']